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本研究利用简单重复序列间区(inter-simple sequence repeat，ISSR)、简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)和扩增片段长度多态性(amplified fragment lengthpolymorphism，AFLP)三种主要DNA分子标记技术，对杏属7个种(类)的30份样品，包括普通杏(Armeniaca vulgaris)、西伯利亚杏(A.sibirica)、辽杏(A.mendshurica)、藏杏(A.holosericea)、紫杏(A.dasycarpa)、梅(A.mume)和李梅杏(A.limeixing)7个种以及仁用杏(kernel-using apricot)类型，进行了遗传多样性检测和生态系统关系研究。
ISSR引物对供试材料扩增，平均每个引物扩增8.7条，多态带百分率94.6％；SSR引物扩增，平均每对引物扩增9.9条，多态带百分率99.0％；AFLP引物扩增，平均每引物组合扩增131.6条，多态带百分率92.0％。表明杏属种质资源中蕴涵丰富的遗传多样性。
三种分子标记检测的样品间相似系数的范围，ISSR、SSR、AFLP分别为0.384-0.927、0.154-1.000、0.592-0.882，平均值分别为0.582、0.325、0.709，说明三种标记对杏种质资源的多态性检测能力为：SSR＞ISSR＞AFLP。
12份仁用杏材料间具有较丰富的遗传多样性；三种标记均可用于仁用杏营养系选种的鉴定；‘油仁和‘丰仁间的相似系数为0.86-1.00，二者可能是同物异名；‘C210-5与母株‘龙王帽相比，在位点CPPCT3发生了突变。
聚类分析结果可以把供试的杏属8个种类明显分为两组，第一组是普通杏、西伯利亚杏、仁用杏、藏杏和辽杏，其中藏杏和辽杏与其它三种亲缘关系相对较远；第二组包括梅、李梅杏和紫杏。主坐标排序也显示，普通杏、西伯利亚杏、仁用杏、藏杏和辽杏五个种类与另三个种梅、李梅杏和紫杏的演化方向不同。
仁用杏的可能进化途径：第一，邻域性物种形成过程中产生的普通杏和西伯利亚杏的自然杂交种，并在人工选择下形成；第二，在普通杏向两伯利亚杏演化的进程中的‘中间类型。
辽杏是华北普通杏的种群通过扩散、迁移到寒冷的尔北，通过自然选择压力形成的新种；而藏杏的演化是由华北向两北迁移后自然选择的结果。
梅应与杏同属；与李梅杏和紫杏一样，梅可能是杏和李的自然杂交种，即原产于黄河流域的杏与原产于长江流域的李杂交形成了梅；与李梅杏相比，梅进化时间更短，反映了它们的地理分布区域、生境特点的差异。