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MiRNA是一类非编码内源性转录后调控小RNA,通过作用于靶基因的3′-UTR,抑制靶基因翻译或者直接导致其降解,以达到对靶基因的调控目的。据统计,miRNA能够调控人基因组近1/3的蛋白编码mRNA,因此,miRNA的挖掘、鉴定和功能验证是当前分子生物学领域的研究热点。体细胞克隆技术是指将动物的的体细胞核移入去核卵母细胞中,构成重组胚,并最终发育成完整个体的技术。克隆牛的早期妊娠率较高,但随着妊娠延续流产和异常妊娠（腹围偏大）时有发生,致使克隆效率较低。本实验旨在利用高通量测序技术,分析异常妊娠体细胞克隆牛和正常妊娠牛母体黄体组织中差异表达的miRNA,筛选并验证表达差异显著的mi RNA,分析得到与妊娠维持相关的候选靶基因,并初步建立与妊娠维持相关的靶基因和miRNA相互作用的调控网络,进而了解妊娠异常的分子调控机制。本研究采集2头180d妊娠异常克隆牛为实验组,3头180d正常妊娠牛为对照组,分别采集其黄体组织。利用Illumina测序平台,鉴定出2069个miRNAs,1759个miRNAs差异表达,其中11个显著上调,22个显著下调。利用SOAP靶基因分析软件预测出5746个靶基因,得出miRNA靶基因富集显著的KEGG通路和GO信号通路。分析发现hsa-mi R-874-5p、hsa-miR-152-5p、bta-miR-495、PC-5p-3504913、PC-3p-4139610与Bax,Caspase-9,TP53,AIF,Caspase-3,Cyto c,Apaf-1,ING2靶基因相互作用,通过调控黄体内的细胞凋亡途径,导致激素分泌水平异常,进而影响母牛妊娠的维持。选取表达量较高的9个表达差异显著的miRNA,利用荧光定量PCR对其在体细胞克隆组与正常妊娠组中的表达水平进行验证,结果显示6个与测序结果一致,3个测序不一致。选取细胞凋亡通路中的11个相关基因,利用荧光定量PCR检测其表达量变化,初步确认了黄体组织中细胞凋亡途径在控制母牛妊娠时的作用机制。本研究发现,实验组与对照组中存在着大量差异表达的miRNA,这些异常表达的miRNA与实验组妊娠异常有关。进一步对相关靶基因表达水平的鉴定发现,一些miRNA对黄体中细胞凋亡通路有一定的调控作用,为后续miRNA的功能验证和黄体中参与妊娠维持的调控机制的探索奠定了基础。