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随着社会经济的快速发展和人口增长，氮化合物的排放量急剧增加，已成为水环境的主要污染之一，危及全球生态环境，引起各界的关注和重视。生物脱氮是目前应用最广泛的脱氮技术，但这一脱氮过程需要不同微生物共同实现。 本文根据水生丛毛单胞菌Comamonas aquatica LNL3具有短程硝化以及短程反硝化的特性，采用好氧和兼氧相结合的方式研究了流化床反应器启动Comamonas aquatica LNL3短程反硝化过程，探讨了该菌种在不同条件下的反硝化情况，采用曲面响应法分析了环境因子（温度、pH、C/N和DO）对该菌种短程反硝化的影响以及优化其生长条件;并探索Comamonas aquatica LNL3转化不同无机氮的机制，提出该菌种的脱氮模型，以期为该菌种的工程化应用提供理论支持，主要研究结论如下: (1)采用好氧和兼氧相结合的方式在流化床反应器中启动Comamonas aquaticaLNL3短程反硝化过程，可增强菌种对亚硝态氮的适应性和耐冲击负荷能力，亚硝态氮去除率在90％以上;短程反硝化速率在进水浓度为200mg/L时达到最大值。 (2)聚合物Poly(HEA)-Poly(HEMA)作为固定化载体，具有良好的生物相容性，适宜微生物的生长和固定化;SEM和FT-IR实验表明微生物成功增殖，生物量约为1.072×104(nmol P/g干重载体)，合计为大肠杆菌(E.coli)大小的细胞约为1.072×1012个。 (3)采用曲面响应法考察温度、pH、C/N和DO对短程反硝化速率的影响;实验表明:曲面响应法适于参数水平的优化，建立的二次函数模型与实际数据具有很高的拟合度(p＜0.0001);对短程反硝化速率影响大小顺序是DO＞温度＞C/N＞pH，温度和DO与短程反硝化速率有显著相关性;短程反硝化的适宜条件是温度31.5℃，pH=8.41，C/N=5，DO=3.37mg/L。 (4) Comamonas aquatica LNL3短程硝化和短程反硝化条件相差不大，菌种可在同一系统中实现氨氮的去除过程。 (5) Comamonas aquatica LNL3具有好氧反硝化特性，适宜在好氧条件下生长，且对亚硝态氮的转化速率远大于对氨氮的转化速率。 (6) Comamonas aquatica LNL3对氨氮，亚硝态氮和硝态氮都具有转化效果，并提出转化模型。相对于传统的短程硝化反硝化过程，本菌种脱氮过程具有广泛的基质来源，无需添加中和剂等优势。