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目的:研究广西扇棘单睾吸虫和其它人体吸虫5.8S rRNA序列和二级结构,探讨人体吸虫二级结构的特征,揭示单睾吸虫之间的亲缘关系。方法:采集广西扶绥县扇棘单睾吸虫,提取其DNA,PCR扩增5.8S rDNA序列并测序。另外选用Genbank登录的7种人体吸虫5.8S rDNA序列进行研究,包括:扇棘单睾吸虫、钩棘单睾吸虫、巨片形吸虫、裂体吸虫、獾似颈吸虫、卷棘口吸虫和猫后睾吸虫。应用DNAman软件把上述人体吸虫5.8SrDNA基因转换成5.8S rRNA。应用RNAstructure3.2软件,根据最小自由能原理,采用Zuker算法,构建5.8S rRNA分子二级结构。应用SPSSv14.0软件对5.8S rRNA一级结构和二级结构组成进行统计分析,人工比对分析部分人体吸虫5.8S rRNA序列和二级结构特征。结果:对广西扇棘单睾吸虫与Dzikowski等报道的扇棘单睾吸虫5.8SrRNA序列进行比较,显示第81、83、84、129、143位碱基发生变异,但这些突变碱基均位于5.8S rRNA二级结构未配对碱基区,碱基突变并未影响5.8S rRNA二级结构。对广西扇棘单睾吸虫与钩棘单睾吸虫5.8S rRNA序列进行比较,发现既存在未配对碱基区的变异又存在配对碱基区的变异,配对区碱基的变异使两者5.8S rRNA二级结构呈现较大差异。对复殖目部分吸虫5.8S rRNA二级结构进行比对分析,结果显示:5.8S rRNA二级结构具有相同的基本结构模式;Ⅰ分支具有1个保守模序为5′-GUGUCGAUG:CAUCGACAU-3′(钩棘单睾吸虫为5′-GUGUCGAUG:CAUCGAUAU-3′)。Ⅱ分支具有1个保守发卡结构,该发卡结构的茎是由9个碱基对组成的保守模序,S.sp保守模序为5′-GGCUACGGG:CCUGUGGCC-3′,其它7种保守模序为5′-GGCCAUGGG:CCUGUGGCC-3′;发卡环为富含尿嘧啶的6元环。在8种人体吸虫中,除裂体吸虫和猫后睾吸虫外,其它6种吸虫5.8SrRNA 5′端均有1段单链序列。在8种人体吸虫中,除钩棘单睾吸虫外,其余吸虫Ⅰ分支均有保守模序5′-GCAG:CUGC-3′。钩棘单睾吸虫和裂体吸虫与其它6种吸虫具有不同的H部和多分支环。巨片形吸虫、獾似颈吸虫和卷棘口吸虫Ⅰ分支尾端具有一个保守发卡结构。碱基的替代、丢失和插入多发生于5.8S rRNA二级结构单链区,双链区的替代、丢失和插入则往往会引起二级结构的较大变异。结论:本研究首次获得广西扇棘单睾吸虫5.8S rRNA基因序列,发现人体吸虫5.8S rRNA二级结构的一些特征。根据单睾吸虫二级结构特征,本研究还发现广西扇棘单睾吸虫与Dzikowski等报道的扇棘单睾吸虫亲缘关系比较近,与钩棘单睾吸虫亲缘关系比较远。