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近年来,我国农业现代化取得显著成果,但同时也造成较严重的农业环境污染,进而严重影响了我国农业的可持续发展。随着绿色发展的理念深入人心,重视农业环境污染治理已是大势所趋,但我国各地区存在多方面差异,这些在一定程度上导致我国各区域农业环境污染治理存在显著差异。为了更好地进行农业环境污染治理,分析我国农业环境污染治理差异并找到差异产生的原因十分必要。为了把握我国农业环境污染的特征,首先在大量文献收集与阅读的基础上,立足于我国发展实际,以环境库兹涅兹曲线、外部性理论等理论为基础对我国农业环境污染进行经济学分析;然后在经济理论分析的基础上,从水资源、土壤资源和大气资源三个维度上构建了指标体系,收集了2004-2016年相关指标数据,利用主成分方法测算了我国各地区的农业环境污染治理水平。本文采用静态分析与动态分析相结合的方法来进一步分析农业环境污染治理的差异来源:首先收集2004-2016年废水排放总量、治理废水项目完成投资额等指标数据并利用锡尔系数的可分解特性计算农业环境污染治理的区域内差异、区域间差异及三大地带的区域内差异贡献率。接着使用ESDA和GIS技术相结合的方法对我国农业环境污染治理得分进行空间自相关分析。最后,在了解我国农业环境污染治理的空间差异的基础上,采用面板数据分析的方法了解我国农业环境污染治理的成因。理论与实证研究结果表明:第一,各地带农业环境污染治理存在显著差异且治理水平在不断变化;第二,我国废水排放治理效果差异仍在不断扩大,二氧化硫排放治理效果的总体差异呈现下降趋势,农用化肥施用程度的总体差异保持平稳且有些许下降;第三,我国农业环境污染治理得分具有空间正相关关系且处在动态变化中;第四,2016年我国呈现高值集聚的有新疆、青海和西藏三个地区,而我国呈现低值集聚有10个集中在东南方向的地区;第五,我国高值集聚的区域在不断扩大但变化幅度较小且低值集聚地区没有发生变化。第六,我国农业环境污染治理受城镇人口比重、工业污染治理完成投资、农作物播种面积等众多因素影响,各影响因素对各地区农业环境污染治理的影响程度不同。本文认为应该从以下方面进行改进:第一,构建环境保护考核体系,加强环境保护教育培训,让大家增强环保意识;第二,加强环境治理学习合作,创新环境治理帮扶制度;第三,坚持走可持续发展之路,推进治理技术研究与应用;第四,建立健全污染监控网络,重点完善治理薄弱环节。