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长牡蛎(Crassostrea gigas),又称太平洋牡蛎,是世界海水贝类养殖行业的重要组成部分。在我国,绵长的海岸线和广袤的浅海水域为发展长牡蛎养殖提供了优越的自然条件,加之国家政策对水产养殖的扶持以及从业人员的努力,我国的长牡蛎养殖业近十多年来发展迅速,取得一系列令人瞩目的成就,为海洋渔业经济的兴盛做出了重要的贡献。随着养殖规模的扩大,出现了不利于行业健康发展的因素。长期以来,牡蛎苗种过于依赖未经改良的野生牡蛎,以及人工养殖条件下经累代养殖造成的近亲交配等原因,导致我国的长牡蛎遗传多样性水平下降,养殖个体出现生长缓慢,死亡率高,品质下降等现象。为了维护产业的良性发展,保护长牡蛎的种质资源,提升其经济效益,在进一步改善养殖环境,提高养殖技术的同时,开展长牡蛎的遗传选育,培育出生长迅速,优质高产的新品种的已成为长牡蛎产业发展的必然要求。本实验在2013年构建了烟台崆峒岛长牡蛎的基础群体,并以壳宽快速生长为选育目标,利用群体选育方法对该群体的长牡蛎进行了连续三代的选育工作,建立了长牡蛎壳宽F1,F2,F3代选育系,同时分别评估了各世代选育系的现实遗传力,选择反应等遗传参数。另外,本实验运用微卫星技术,分析了3代壳宽快速生长选育系的遗传变异以及选育对其遗传变异的影响。同时,本实验首次将近红外光谱技术(Near Infrared,NIR)在贝类遗传育种过程,建立了长牡蛎的必须氨基酸分析模型。主要研究结果如下:1长牡蛎壳宽连续3代选育群体的遗传参数比较长牡蛎第一代选育中,壳宽F1代选育群体的平均选择反应为0.491±0.26,平均现实遗传力为0.330±0.131。第二代选育中,壳宽F2代选育群体的平均选择反应为0.604±0.24,平均现实遗传力为0.396±0.135。第三代选育中,壳宽F3代选育群体的平均选择反应为0.764±0.27,平均现实遗传力为0.471±0.133。从壳宽性状的选育成效而言,第一代至第三代选育过程中在提高长牡蛎的壳宽生长速度上取得了令人满意的效果,在360日龄,即长成期,每代壳宽平均增长7.95~12.1%。2长牡蛎壳宽选育世代的群体遗传变异分析所有微卫星位点在4个群体中都表现出了较高的多态性,P0,F1,F2和F3代群体的平均等位基因数为16.5、12.2、12.8、10.7;P0,F1,F2和F3代群体多态性信息含量(Pic)的平均数值分别为0.9068、0.8982、0.8836、0.8789;所有群体10个位点的观测杂合度值(Ho)均小于期望杂合度值(He),观测杂合度平均值的大小范围是0.5775~0.6484,期望杂合度范围是0.8897~0.9297;哈迪—温伯格平衡(HWE)结果显示:4个群体在10个位点上有32个群体—位点组合显著偏离HWE平衡(P<0.05),说明人工选育对群体的遗传结构造成了一定的影响;4个群体在10个位点上的Fis值均为正值,平均范围为0.1541~0.2341,表明群体内各位点上的杂合子比例有所下降;各群体间Fst值范围为0.0089~0.0245,遗传分化程度较弱。3长牡蛎肉质必须氨基酸近红外(NIR)定量分析模型的建立构建的长牡蛎必须氨基酸近红外(NIR)分析模型中,校正集与交互验证集的决定系数(R2)分别为RCal2=0.9545和RCV2=0.9227;两个集的均方根误差(RMSE)分别为RMSECal=0.998和RMSECV=1.313;两个集的相对分析误差(RPD)分别为RPDCal=4.34和RPDCV=4.40,结果显示:模型预测值与化学测量值拟合程度高,二者偏差小。由此可表明长牡蛎肉质必需氨基酸NIR模型的预测效果良好,预测精度较高。