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经过20多年的理论研究与生产实践，我国生态农业建设取得了很大的成绩。已从初期的生态农业户、村、乡，发展到目前的生态农业县建设。正是存在这样的尺度转换的问题，一些微观尺度(户、村、乡)上取得的成功经验如何在更大的尺度(县域)上推绎，如何将微观与宏观相结合，需要对县级生态农业规划理论方法进行科学的研究。针对目前生态农业规划理论方法存在相对滞后的问题，本文初步提出以复合生态系统理论为核心，以景观生态学相关原理作为区域生态农业景观空间格局规划的理论基础和以循环经济理论作为区域生态农业产业规划的理论基础的理论体系。并在此基础上建立区域生态农业规划方法程序，包括复合生态系统分析和生态农业规划两大块。复合生态系统分析中主要采用复合系统纵横向分析法、景观空间格局分析法、社会经济资料数据的统计分析方法等，县域生态农业规划包括生态农业景观空间格局设计和生产农业产业网络模式设计。以胶南市为例，运用系统分析方法对自然—社会—经济复合生态系统分析评价，包括农业生态背景分析评价、农业经济社会系统分析评价和区域土地利用景观格局分析。农业生态背景分析包括自然环境要素概况、农村生态环境问题分析和生态敏感性评价。农业经济社会系统分析评价主要包括：全县范围内的农村人口及劳动力状况分析和经济结构分析，乡镇水平上的社会经济聚类分析。并采用景观格局指数分析胶南土地利用空间格局。在自然环境条件分析与社会经济发展程度聚类分析的基础上提出胶南市生态农业建设一级分区。胶南市生态农业规划是在进一步对各区生态农业发展背景分析基础上，一方面确定各区生态农业功能定位，提出生态农业产业网络模式；一方面依据生态敏感性和土地利用格局确定二级分区控制，进行生态农业景观空间格局设计。