【摘 要】
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本研究以北极狐为研究对象,以同一个体的皮肤组织为对照样品研究了35个个体的毛干微卫星分型情况。采用苯酚—氯仿法提取皮肤和毛干的基因组DNA,设计了12个位点PCR引物。通过
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本研究以北极狐为研究对象,以同一个体的皮肤组织为对照样品研究了35个个体的毛干微卫星分型情况。采用苯酚—氯仿法提取皮肤和毛干的基因组DNA,设计了12个位点PCR引物。通过PCR扩增体系的优化,从12个位点中筛选出5个在皮肤DNA扩增较为稳定的微卫星位点,其中AJ411682是单态性位点。以皮肤DNA的扩增结果为参照,计算了毛干DNA扩增的阳性率、正确率、等位基因频率、基因型频率、表观杂合度、期望杂合度、匹配概率、个体识别能力和累计个体识别能力等指标,研究和评估了毛干样品DNA的分型情况。结果显示,毛干在微卫星位点X94309、AJ269545、AY223968、AJ132981和AJ411682扩增阳性率分别是100.00%、80.00%、82.35%、60.00%和60.00%,扩增正确率分别是91.43%、74.29%、73.53%、48.00%和60.00%;皮肤和毛干在四个多态性微卫星位点的表观杂合度、期望杂合度、匹配概率和个体识别能力之间没有显著统计学差异。皮肤累计个体识别能力是0.975055097,毛干累计个体识别能力是0.969098611。上述结果表明,(1)毛干中提取的基因组DNA可以成功扩增出100bp左右的微卫星产物,240bp左右的片段难以成功扩增;(2)毛干的扩增正确率因微卫星位点而异;(3)毛干微卫星分型成功率最重要的影响因素是毛干能够提供的模板量;(4)针对毛干样品的微卫星位点在实际应用之前必须对基本遗传学参数进行比较和评估。
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