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microRNA(miRNA)是一类重要的非编码小分子RNA调控因子，通过控制其靶标基因的表达水平来参与个体发育、分化等生命活动。部分miRNA已被证实具有类似原癌基因和抑癌基因的功能，在肿瘤的发生和发展过程中起关键的调控作用。miRNA通过改变其下游的靶标原癌基因或抑癌基因的表达而影响细胞增值、凋亡、侵袭和血管生成活动，促使肿瘤的形成发展。
miRNA表达谱可以同时检测整个miRNA组在多个样本中的表达水平。根据表达谱识别差异表达miRNA也成为发现癌相关miRNA的重要手段，已被广泛用于肿瘤分类、诊断、预后。然而，不同实验室所用的数据预处理方法、选取差异表达miRNA的检验方法和标准都存在很大的差异。现有的综述和数据库都只是简单地把不同文献中的差异表达miRNA综合在一起，没有进一步将所有的数据结果进行综合分析。
我们认为：使用统一方法处理表达谱数据，进而对各组数据的结果进行整合分析，将能得到更为全面可靠的癌候选miRNA。为此，我们下载了34套肿瘤对照正常样本的miRNA表达谱，并采用相同的预处理方法、选取差异表达miRNA。然后设计癌相关得分来识别在多套表达谱中差异表达且差异表达程度较高的癌候选miRNA。此外，考虑到miRNA具有较强的组织特异性，不同的癌症的相关miRNA差异较大，我们进一步将癌候选miRNA区分为癌通用miRNA和癌亚型特异miRNA。结果产生187个癌候选miRNA，包含81个在少数几种癌症中差异表达的癌亚型特异miRNA。通过整合miRNA靶标基因数据库和癌基因数据库发现，癌候选miRNA显著富集具有靶标癌基因的miRNA。识别癌亚型特异miRNA有利于探索特异的癌通路和药物靶点，为生物学实验提供有用的指导。