海拉(Hela)细胞在受到表皮生长因子刺激及恢复阶段的磷酸化蛋白质组与糖基化蛋白质组动态变化研究

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蛋白质磷酸化和糖基化是蛋白质翻译后修饰中最为常见的两种。蛋白质磷酸化与去磷酸化往往作为细胞内部信号蛋白和调控因子的关键性开关,蛋白质糖基化往往作为蛋白与蛋白之间的相互识别的重要结构。表皮生长因子(EGF)是人体内广泛存在的生长因子,对细胞的生长和增殖具有促进作用。有关EGF对细胞内信号通路的影响的研究相对较多,但基本都是注重于EGF刺激细胞时期的细胞内相关信号蛋白的表达水平变化,或是某种修饰(如磷酸化等)的动态变化。尚没有系统地、同时从整个磷酸化蛋白质组和糖基化蛋白质组的层面对细胞接受刺激以及去掉刺激以后的一段时间内的各个时间节点的蛋白的翻译后修饰变化情况进行研究的报道。  本研究利用TiO2和IMAC的组合方法,同时富集磷酸化肽和含有末端唾液酸的糖链的糖基化肽段,以Hela细胞作为材料,用EGF刺激Hela细胞5min,然后撤掉EGF的刺激,观察细胞在半小时的恢复时间段内蛋白质磷酸化和糖基化的动态变化。对实验数据采用Fuzzy-C-Means Cluster聚类算法进行聚类分析。得到10个不同的磷酸化变化趋势的Cluster,6个不同的N-糖基化水平变化趋势Cluster。分析发现,Hela细胞中的差异表达的磷酸化蛋白在受到EGF刺激5min以及后续的30min恢复期内,出了多样化的磷酸化动态变化模式,并发现同一个蛋白上多个磷酸化位点展现出各自不同的磷酸化水平变化模式是很常见的一种现象。蛋白质糖基化变化的趋势总体和磷酸化类似,但是数量上要少很多,大概只有磷酸化的1%左右,仅有的发生差异变化糖基化的蛋白大部分分布在细胞质和细胞核中,主要参与转录和蛋白功能的调节。同时也发现某些抑癌蛋白的糖基化水平在本实验的条件下发生持续下调。  综上,本实验展现出了不同的蛋白以及其磷酸化和糖基化修饰在接受EGF和去掉EGF的时期的多样性的动态变化,给以后更加深入研究EGF对细胞的影响提供了重要参考。
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