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本文从“高校校办企业管理体制”和“高校校办企业管理模式”的核心概念出发，运用高等教育学、社会主义市场经济理论和公共企业管理学的理论方法，分析中国高校校办企业管理模式存在的弊端，在对北京大学和清华大学等高校校办企业管理体制改革进行实证分析的基础上，提出中国高校校办企业管理体制改革的对策思考。 第一章绪论，对研究缘起和意义、相关研究成果、本文的研究方法和思路等进行了阐述。 第二章先是从历史角度考察，分析了高校校办企业的地位和作用，指出高校校办企业是人类社会经济发展的产物，它与新中国的建设事业共发展，并为中国高等教育做出了贡献。然后从现实状况出发，分析中国高校校办企业在发展中面临的困境，指出市场经济条件下高校校办企业的两极分化，导致高校校办企业的发展从整体来说步入了困境，而高校校办企业又在困境之中孕育着新的变革。 第三章从管理体制层面分析，指出管理体制弊端是制约中国高校校办企业发展的瓶颈，认为其原因主要是高校与校办企业产权上的纠缠不清、高校校办企业运行机制上的双重性、高校校办企业管理上的事业单位化。在此基础上，提出在实施科教兴国战略、建设人力资源强国的今天，高等教育的发展需要校办企业的支持，而校办企业的发展则亟需管理体制的完善。 第四章通过对北京大学、清华大学两所著名高校校办企业成功进行管理体制改革试点的案例分析，总结了一些有益的启示，这就是:利用优势，致力校方科技成果转化;体制创新，建立新型校企关系模式;规范管理，寻求技术与管理的平衡。 第五章提出了校办企业管理体制改革的对策思考。首先从思想认识层面，指出明确功能定位是高校校企管理体制改革的认识基础，这就要求认清高校创办校办企业的主要目的，明确高校与校企的不同理念和功能，实现高校与校企科研上的双赢合作。其次从校企关系层面，指出理顺校企关系是高校校企管理体制改革的中心内容，提出要以资产管理为纽带建立新型的校企管理体制，拓宽融资渠道实现校办企业投资主体多元化，同时政府部门应对高校校办企业给予必要的支持。最后从内部管理层面，指出实现规范管理是高校校企管理体制改革的根本措施”，提出要规范高校的投资行为和经营活动，建立校企内部新型劳动人事制度，健全财务管理制度提高业务水平。 第六章结论，对全文的基本观点进行了概括总结，指出:解决当前市场经济条件下高校校办企业生存和发展问题，根本措施是高校对校办企业的管理体制进行改革，而改革的核心问题是建立新型校企关系，大力扶持发展高技术型校办企业，促进高校实现培养专门应用型人才、促进科技成果转化和社会服务三大职能，为经济社会的全面、协调、可持续发展贡献力量。