【摘 要】
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该文报道了第二次全国HIV-1分子流调(2001—2002)主要流行重组株B′/C Tat基因第一外显子的序列特征,并把此次分子流调中的CRF07-BC Tat基因第一外显子变异情况与第一次全国
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该文报道了第二次全国HIV-1分子流调(2001—2002)主要流行重组株B′/C Tat基因第一外显子的序列特征,并把此次分子流调中的CRF07-BC Tat基因第一外显子变异情况与第一次全国分子流调(1996—1998)的CRF07-BC Tat基因第一外显子变异情况作了比较,同时用真核表达系统对CRF07-BC Tat基因第一外显子和其相应的LTR的相互作用进行了比较研究.一.中国HIV-1主要流行重组株B′/C Tat基因第一外显子序列特征分析 经PCR扩增和测序共得到中国HIV-1 B′/C亚型Tat序列154条,其中CRF07-BC为120份,CRF08-BC为34份,两种亚型广泛分布在中国多个省市.两种类型重组株第一外显子氨基酸序列的差异主要为半胱氨酸富含区和核心区的变化.二.两次全国HIV分子流行病学调查CRF07-BC重组株Tat基因变异特征分析 第二次全国HIV分子流行病学调查中CRF07-BC Tat基因第一外显子主要氨基酸变化表现在Tat蛋白的第7、10、39、57位点.其中第10位氨基酸的出现频率在第二次流调中已经出现明显变化,Ser(丝氨酸)位点出现比例由第一次流调的56.7%下降到2.5%;第一次流调中发现的39、57位点的变化还存在,但在比例上有些改变,尤其是57位点,第二次流调中出现R(精氨酸)的比例增加.三.CRF07-BC重组株Tat基因第一外显子突变对功能影响分析 把部分HIV-1 CRF07-BC Tat第一外显子基因克隆到pcDNA3.1,构建质粒pcDNA-Tat LTR基因克隆至pGL3-promoter构建质粒pLUC-LTR,共转染293T细胞,进行瞬时表达,并检测荧光素酶活性,发现Tat蛋白57位为R(碱性氨基酸)的突变类型活性最高,与分子流行病学调查结果吻合.
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