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目的：探讨环氧化酶(COX-2),血管内皮生长因子(VEGF)在胃肠间质瘤(GISTS)中的表达及其在预后判断中价值。方法：应用免疫组织化学S-P法对52例胃肠间质瘤(GIST)检测,观察COX-2、VEGF在胃肠间质瘤中的表达情况。分析两者与胃肠间质瘤患者的性别、年龄、肿瘤原发部位以及与胃肠间质瘤的组织学分级、肿瘤直径、侵润转移和核分裂数的关系。所有资料应用SPSS13.0统计软件进行统计分析,P<0.05认为差异有统计学意义。结果：COX-2、VEGF在胃肠间质瘤中的阳性表达率分别为57.69%(30/52)、78.84%(41/52),两者的表达与胃肠间质瘤的组织学分级、肿瘤直径、浸润转移和核分裂数有关(P<0.05),而与患者的年龄、性别、肿瘤的原发部位无关(P>0.05)；COX-2、VEGF在极低和低危险组,中度危险组和高危险组以及直径<2cm、直径2-5cm和直径>5cm组间有差异(P<0.05),高表达率随恶性程度的增加和肿瘤直径的增大而增加(P<0.05),在有浸润转移和核分裂数≥5/50HPF组中的表达明显高于无浸润转移和核分裂数<5/50HPF组中的表达(P<0.05)。在COX-2、VEGF相关分析中,二者具有正相关性(P<0.01),提示COX-2在基因水平协调VEGF的表达。结论：胃肠间质瘤中VEGF和COX-2蛋白表达上调,与胃肠间质瘤的发生、发展、转移及浸润密切相关。VEGF和COX-2表达在胃肠间质瘤呈正相关,联合检测有助于恶性程度的评价,判断其预后,从而指导临床治疗。