基于全卷积神经网络的心脏磁共振图像分割与量化分析

来源 :电子科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hyman_han
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
心脏磁共振(Magnetic Resonance Imaging,MRI)图像自动分割与量化算法能够自动绘制心脏解剖结构的轮廓,并能精确测量心脏功能的量化参数,实现心血管疾病的精准分析,从而提高医生诊断心血管疾病的准确性与效率,因此成为当前医学图像处理领域的研究热点。传统心脏MRI图像分割算法在自动化程度、计算效率和鲁棒性方面存在一定的不足,难以满足医院对大规模心脏MRI数据处理的需要,而基于全卷积神经网络(Fully Convolutional Network,FCN)的图像语义分割算法,能够提取心脏磁共振图像多尺度、深层次的抽象特征,增强分割模型对MRI噪声、强度不均匀性、弱边界和形状变化等因素的抗干扰能力,并且其端对端的工作模式提高了数据的利用率、简化了模型的设计流程,因而成为当前心脏MRI图像自动分割领域的主流趋势。本论文就心脏MRI图像的左心室分割、左右心室分割、左心室17节段分割及动态心脏MRI图像量化分析等问题展开了深入的研究工作,主要研究内容如下:1.基于FCN模型,提出了一种心脏MRI图像左心室自动分割算法。通过动态像素加权策略调整训练阶段损失函数各样本的权重值,引导FCN模型重点分类难分类的像素,从而提高了FCN模型对心脏MRI图像左心室基底部和心尖部的分割效果。此外,基于凸包算法与形态学处理方法提出了一个后处理算法,用于修复左心室分割结果的环状结构,从而准确提取分割结果的心内膜与心外膜轮廓。2.基于两阶段FCN模型,提出了一种心脏MRI图像左右心室自动分割算法。利用第一阶段的FCN模型检测心脏MRI图像左右心室的中心点位置,用于提取感兴趣区域,并作为先验信息辅助第二阶段的全卷积神经网络模型分割中心点附近的左右心室,有效解决了已有算法在左心室心尖位置的欠分割与过分割问题。此外,提出了一个基于假阳与假阴率评价指标的损失函数,有助于提高FCN模型的分割性能。3.基于两阶段FCN模型和左心室17节段标准模型,构建了一个心脏MRI图像左心室17节段自动分割系统。利用两阶段FCN模型提取心脏MRI图像的解剖结构关键点和左心室心肌区域,然后基于极坐标变换方法构建以左心室为原点的极坐标空间,最后根据左心室17节段标准定义和关键点信息将左心室分割结果分段为17个节段,从而有效解决了左心室17节段无实际边界而难以分割的问题。4.基于提出的心脏MRI图像分割算法,构建了一个动态心脏MRI心室功能自动量化系统。利用心脏MRI图像左右心室与左心室17节段自动分割算法获取左右心室以及左心室17节段分割结果,然后通过分析左心室体积随时间变化曲线识别出心室舒张末期和收缩末期时间点,最后分别基于心室功能参数计算公式和欧氏距离变换提取分割结果中的量化指标,实现心脏MRI的定量分析。本文所提出的算法在多个公开数据集进行性能测试与评估。实验结果表明,以上算法可以有效解决现有心脏MRI图像分割存在的问题,实现高效准确的心脏MRI量化分析。
其他文献
学位
黄瓜的果实长度是决定黄瓜形状和大小的主要因素,也是影响黄瓜产量和商品品质的重要农艺性状。我国是世界上黄瓜种植面积和产量最大的国家,且品种专用化对黄瓜果长的要求逐年提高,如华北鲜食类型黄瓜果长为30~40 cm,华南型黄瓜果长约为20 cm,水果黄瓜果长约为12~15 cm。因此,挖掘和克隆控制黄瓜果长的基因,揭示黄瓜果长的调控机理,对黄瓜品种的果长多样化育种具有重要的理论和应用价值。目前虽通过自然
学位
梨(Pyrus L.)属于蔷薇科植物,是国内外栽培的大宗果树之一。梨果皮色泽有绿色、黄绿色、黄色、褐色和红色,其中红皮梨因其果皮颜色鲜艳、富含花青苷类物质深受消费者的青睐。植物中花青苷的积累呈现昼夜节律性变化,在梨等大多数果树中花青苷生物合成的昼夜节律性调控还不清楚。本研究以‘红早酥’梨(Pyrus cv.‘Hongzaosu’)果皮为主要试验材料,其他梨品种‘红丝绸’(Pyrus communi
葡萄是世界性果树,具有重要经济价值。生产上广泛栽培的欧洲葡萄(Vitis vinifera)易感多种病害,尤其是白粉病。目前主要采用化学防治法防治葡萄病害,虽然效果好,但对生态环境和人体健康危害较大。相比而言,利用野生种葡萄的抗病基因改良欧洲葡萄的抗病性会更加安全与高效。我国拥有丰富的野生葡萄抗病资源。然而,关于中国野生葡萄白粉病抗性的细胞学特征与遗传规律等问题,尚未有明确结论。此外,最新研究表明
棉花是世界上最重要的纤维作物,在我国的国民经济中占有举足轻重的地位。近年来,因机械化程度低、劳动力成本升高、粮棉争地等问题,我国黄河流域和长江流域植棉面积快速减少。早熟棉是一种重要的棉花品种类型,其生育期较短,且吐絮期集中。培育更多早熟棉品种成为解决当前植棉困局的重要方法。棉花生育期和吐絮期主要取决于其开花时间,但是关于棉花开花时间调控的分子机制的报道较少,只有很少的开花基因被鉴定到。光周期是最可
学位
学位
陆地生态系统净CO2交换(Net ecosystem exchange of CO2,NEE)是陆地总初级生产力(GPP)与生态系统呼吸(RE)的差值,表现为陆地生态系统吸收大气CO2的能力。在大气CO2含量升高导致全球气候变化的背景下,明确陆地生态系统NEE的总量、空间格局以及未来的变化规律至关重要。然而,NEE空间变异机理尚不清楚,导致模型模拟和预测存在较大不确定性。目前大多数模型基于植被功能
糖尿病视网膜病变(Diabetic Retinopathy,DR),简称糖网,目前已经成为了成年人视力下降甚至失明的主要原因,是糖尿病主要的综合症之一。本文针对糖尿病诱发病视网膜病变的眼底图像,开展了病变检测和病变评估等相关研究,取得了一定的研究进展。本文研究主要包括以下几个方面:1.针对眼底图像采集过程中的亮度不一致、光照不均匀、对比度较低及存在反光等各类成像质量问题及对后续检测不利因素,开展了