结肠癌脂肪酸代谢特点及DNA甲基化关系的研究

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[目的]   建立气相色谱质谱法和液相色谱串联质谱分析组织脂肪酸和DNA甲基化方法,比较结肠癌患者肿瘤组织和癌旁组织脂肪酸的相对含量变化以及DNA甲基化水平的改变,寻找脂肪酸代谢和DNA甲基化在肿瘤组织中的特点,探讨脂肪酸代谢以及DNA甲基化与肿瘤发生发展之间的联系,为研究脂类与肿瘤的发生发展关系和肿瘤诊断标志物提供科学依据。   [方法]   (1)组织脂肪酸提取以及分析:采用脂肪酸提取衍生一步法,在组织中加入正己烷和14%三氟化硼/甲醇,充氮气后密封,100℃水浴加热1小时后加入三重蒸馏水,然后吸取上清,用氮气吹干后,再用正己烷150μL定容,最后用气相色谱质谱仪分析组织脂肪酸含量。   (2)组织DNA提取:在组织中加入蛋白酶K进行消化,然后加入苯酚-氯仿进行除蛋白,最后加入乙醇把DNA沉淀下来,用紫外分光光度计进行DNA浓度以及纯度的检测。   (3)组织DNA裂解:DNA样品加入88%甲酸在140℃反应90 min进行裂解。   (4)气相色谱质谱分析DNA甲基化:裂解后的DNA氮气吹干后,加入BSTFA(1%TMCS),乙腈和吡啶进行衍生,然后离心,取上清,然后用气相色谱质谱仪进行分析。   (5)液相色谱串联质谱分析组织DNA甲基化:裂解后的DNA氮气吹干后,用甲醇溶解后离心,取上清,然后用液相色谱串联质谱仪进行分析。   [结果]   (1)通过分析35例结直肠癌患者肿瘤组织和癌旁组织的脂肪酸,比较肿瘤组织和癌旁组织之间脂肪酸的差异,SFA、18:0/18:1、20:2和n-6/n-3在肿瘤组织中的含量比癌旁组织的高且具有显著性差异,18:1、20:5、20:5/20:4、22:6/22:4在肿瘤组织中的含量比癌旁组织低也具有显著性差异。   (2)通过比较不同肿瘤分期的结直肠癌患者中脂肪酸含量,比较不同肿瘤分期的脂肪酸之间的差异,发现C期结肠癌患者肿瘤组织中18:2和n-6脂肪酸的含量比B期高具有显著性差异。   (3)在建立气相色谱质谱检测组织DNA甲基化方法时,通过正交实验优化胞嘧啶和5-甲基胞嘧啶的衍生条件,得到其最佳衍生条件为100℃下加入50μLBSTFA(1%TMCS),40μL乙腈和10μL吡啶反应45min。胞嘧啶和5-甲基胞嘧啶衍生物在气相色谱质谱分析方法中容易分离,且最低检测限为0.05ng,日内RSD分别为2.11%和5.23%,日间RSD分别为4.80%和9.41%,相对回收率分别为88.52%和92.35%。   (4)在建立液相色谱质谱检测组织DNA甲基化方法时,通过乙腈和甲酸铵在亲水柱中达到分离,且胞嘧啶的线性范围为(1~100)ng/mL,相关系数为0.9974,相对标准偏差为0.70%~4.09%;5-甲基胞嘧啶的线性范围为(1~50)ng/mL,相关系数为0.9948,相对标准偏差为0.60%~4.81%。胞嘧啶和5-甲基胞嘧啶的检出限为1pg,日内相对标准偏差分别为1.94%~2.83%,日间相对标准偏差为2.17%~4.44%,胞嘧啶和5-甲基胞嘧啶的加样回收率为86.52%~105.14%。   (5)通过液相色谱串联质谱分析结直肠癌患者肿瘤组织和癌旁组织中DNA程度,发现肿瘤组织中的DNA甲基化水平比癌旁组织的DNA甲基化低(P<0.05),表示低甲基化有利于肿瘤的发生。另外比较不同肿瘤分期结肠癌患者组织DNA甲基化的差异,发现处于C期的结直肠癌患者中的DNA甲基化水平比处于B期的低(P<0.05)。   (6)通过分析组织中脂肪酸含量以及DNA甲基化程度,发现组织脂肪酸与DNA甲基化具有一定的相关性,如16:0、18:1、18:2、20:4、22:4、n-6、n-6/n-3和18:0/18:1在组织中含量或比值增加,其相对应的DNA甲基化水平则降低(P<0.05)。   [结论]   本文建立了气相色谱质谱和液相色谱串联质谱分析组织脂肪酸和DNA甲基化的方法,运用该方法分析了结直肠癌患者肿瘤组织和癌旁组织中脂肪酸以及DNA甲基化的程度。结果显示:与癌旁组织相比,肿瘤组织中18:1降低、n-6脂肪酸升高,n-6脂肪酸随着肿瘤分期的递增而增加;肿瘤组织中DNA甲基化水平显著降低;16:0、n-6系列脂肪酸在组织中含量的增加伴随着DNA甲基化水平的下降。这些结果表明某些脂肪酸和DNA甲基化的变化与肿瘤的发生发展密切相关,脂肪酸的代谢异常可能引起DNA甲基化的改变并导致肿瘤的产生。该结果为深入研究肿瘤诊断及治疗标志物提供了科学依据。
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