论文部分内容阅读
蓝莓是杜鹃花科(Ericaceae)越橘属(Vaccinium)多年生木本植物,具有极高的营养价值。本研究运用DNA条形码技术及表型性状多样性对蓝莓种质资源进行综合分析,探究不同品种间的遗传分化状况及遗传多样性。对部分品种的8个条形码片段(rpoB、psbA-trnH、ycf5、rbcL、rpoC、matK、ITS、ITS2)进行扩增与测序,分析扩增效率及测序成功率、品种间和品种内遗传距离、barcoding gap、并对遗传距离计算结果进行Willcoxon检验,利用NJ树法对各蓝莓品种进行聚类分析。对蓝莓不同品种的表型性状进行整理,结合聚类分析、相关分析、主成分分析、香农-维纳多样性指数等分析方法及指标对表型遗传多样性研究。主要结论如下:(1)在8个DNA条形码中,条形码ITS与ycf5在所有蓝莓样本中均无扩增产物。除matK序列扩增成功率(96.30%)、测序成功率(99.04%)相对较低外,其它5个条形码扩增与测序成功率均为100%。各条形码的变异位点数依次为:ITS2(11个)>matK(4个)>rbcL(3个)>psbA-trnH(2个)>rpoC(1个)>rpoB(0个)。各蓝莓品种的品种内、品种间遗传距离较小,介于0.00016-0.00258之间,且品种间遗传距离大于品种内。(2)Barcoding gap分析结果显示,各条形码均未形成明显的间隔区,但从分布情况看,ITS2、psbA-trnH、matK 3个条形码有偏向两端分布的趋势,尤其是ITS2。Wilcoxon检验显示,条形码ITS2、psbA-trnH品种间变异较大,条形码psbA-trnH品种内的变异较大。聚类分析结果表明,条形码psbA-trnH和rpoC可将蓝莓品种分为2个类群,条形码rbcL和matK将蓝莓划分为3个类群,条形码ITS2将蓝莓分为4个类群。利用条形码组合可提高蓝莓品种鉴定率,其中ITS2+matK+rpoC+rbcL鉴定成功率最高为20%。(3)主成分分析表明,前4个主成分方差累计贡献率53.477%,其中特征根值大于0.5的有25个性状,占调查指标的67.57%,包含树形因子、叶形因子、果实因子,能够代表蓝莓的表型特征。15个质量性状,包含55个变异类型,平均变异类型3.4个,香浓维纳指数在0.32~1.36之间,平均为0.87;22个数量性状中,各性状间相关性有差异,或呈正相关,或呈负相关,变异系数在4.77%~47.37%之间,单果重量表现出最大的变异,果型指数表现出最小的变异,香浓维纳指数在0.22~2.06之间,平均为1.80。(4)根据相关分析、主成分分析、R型聚类分析结果,对37个测试性状进行降维处理,最终筛选出25个遗传信息丰富的性状,并做Q型聚类。结果表明当欧式距离Ll=17时,将所有品种划分为5个类群,发现其聚类结果与栽培生境和栽培类群有相关性。