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学术论文是学者之间相互交流的重要渠道之一。研究方法作为学术论文的重要组成部分，不仅起到了沟通研究问题与研究结果、讨论的桥梁作用，而且直接影响研究的信度与效度。目前关于学术论文研究方法部分的体裁分析屈指可数，主要涉及医学、生物学等自然学科，而对于社会学科，尤其是语言学类与经济学类方法部分的体裁结构对比研究很少。本研究从体裁结构和语言特征两个方面对比分析应用语言学与应用经济学学术论文研究方法部分，目的是了解和掌握两个不同学科英语学术论文方法部分的结构和语言特点，探索两学科学术论文方法部分写作的共性与特性。 本研究采用研究者自建语料库，选取两学科2014-2015年间60篇国外权威学术期刊论文研究方法部分为语料;运用Swales(1990)的“语步-步骤”体裁分析单位，以Yang(2014)和Lim(2006)的方法部分体裁分析框架为基础，采用新语步模型划分语步结构，并对比分析不同学科方法部分在语步构成和语步次序方面的异同性。同时，运用AntConc3.2.1对比分析方法部分在时态、语态特征方面的异同性，从而为研究方法部分的学术写作提供语言上的规范性。 研究结果表明，应用语言学与应用经济学学术论文方法部分在体裁结构和语言特征方面拥有各自的写作特点，总结如下: (1)体裁结构方面:语言学类与经济学类方法部分一般由6语步、21步骤构成，即背景信息(M1)、数据收集(M2)、被试者信息(M3)、变量测量(M4)、实验描述(M5)、数据分析(M6)。但是经济学类方法部分并未包含实验描述，这可能是因为其研究大多基于自然数据。 (2)体裁结构异同性:语言学类方法部分侧重包含4个语步，基本次序为:M3-M2-M5-M6;而经济学类方法部分侧重包含3个语步，基本次序为:M2-M4-M6。这一显著差异可能是因为学科间差异性导致的。 (3)语言特征方面:语言学类方法部分更侧重于采用过去时被动语态，而经济学类方法部分更侧重采用现在时主动语态。这一差异可能是因为语言学研究更多基于个体实验数据，而经济学研究更多基于客观自然数据。 本研究不仅丰富了专门用途英语体裁分析理论，而且促进了体裁分析理论在学术写作教学中的应用，对应用经济学和应用语言学专业学生撰写英文学术论文方法部分具有重要的指导意义。