基于二代测序技术对小鼠慢性肝炎恶性转化中驱动突变基因的研究

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原发性肝癌(HCC)是对人类危害最严重的恶性肿瘤之一,HCC在我国的发病率居于世界首位,主要由HBV病毒感染导致的慢性肝炎恶性转化而来。在HCC发生发展过程中,病毒的感染,炎性分子对机体组织造成的损伤,以及机体自身修复功能的缺陷都会导致自身基因组的改变。这些基因组的变异对于我们理解HCC的发生和发展以及开发特有的生物标记物具有重要的意义。  随着高通量基因组分析技术的不断进步,对小鼠肿瘤模型进行深度测序为我们发现新的癌基因,理解肿瘤的发生机制提供了新的视角。在实验室前期的研究中,给HBV转基因小鼠注射抗CD137激活型抗体可以诱导小鼠发生炎症,进而发展为肝脏纤维化,肝硬化最终导致肿瘤。这个小鼠模型可以很好地模拟临床上HCC的发病全过程,并且小鼠模型的个体差异小,受到的外界环境干扰少,所以利用这个小鼠慢性肝炎恶性转化模型进行测序分析对于我们发现新的癌基因以及探讨肿瘤的发生具有很大的优势。  在本课题中,我们对来自4只小鼠的12对肿瘤及癌旁进行了全外显子组测序,共发现有46个基因发生了单核苷酸突变。接着我们对这46个突变基因进行了分析和筛选,发现其中有37个基因已经被证明与肿瘤有关。在剩下的9个基因中,GM7173基因是一个功能未知的新基因,并且在这个小鼠上只发生了3个有义突变,这提示GM7173可能与肿瘤发生有着重要的关系。我们对其序列和功能进行了初步的研究。  在肿瘤发生和发展过程中有丝分裂检查点基因的功能失活会导致细胞周期的紊乱,对于肿瘤的发生有着重要的促进作用。在这9个没有被报道与肿瘤有关的基因中,我们观察到一个有丝分裂检查点的调控基因P31(comet),通过对P31(comet)分子和突变体的研究,我们发现这个位点可以使P31(comet)功能失活但却与靶蛋白MAD2亲和力显著升高,我们进一步对这个突变体在有丝分裂检查点复合物(MCC)中的作用进行了研究,结果表明P31(comet)在有丝分裂中发挥着复杂又重要的作用,这个突变位点对于我们理解MCC的组装和解聚提供了新的视角和工具。  本课题立足于原发性肝癌,通过采用慢性乙肝恶性转化小鼠模型进行NGS测序分析寻找肿瘤驱动型突变,在原有的研究基础之上找到了9个新的单核苷酸突变,其中包括一个功能未知的基因GM7173,对其在肝癌中的剪切形式以及在肝癌和其它肿瘤中的表达进行了初步的研究;另外在9个单核苷酸突变中还有一个在有丝分裂过程中发挥重要功能的基因P31(comet),借助P31(comet)的突变体,我们研究了这个突变体在MCC的组装和解离中发挥的重要作用,以及这个基因在肿瘤发生和发展过程中对有丝分裂的重要影响。
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