MicroRNA基因变异在2型糖尿病及非小细胞肺癌发生发展中的作用

来源 :北京协和医学院中国医学科学院 北京协和医学院 中国医学科学院 清华大学医学部 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Lyben
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糖尿病是由多种病因引起的代谢紊乱,其特点是慢性高血糖,伴有胰岛素分泌不足和(或)作用障碍,导致碳水化合物、脂肪、蛋白质代谢紊乱,造成多种器官的慢性损伤、功能障碍等。截止2013年,全球有3.82亿糖尿病成年患者,中国有糖尿病患者0.98亿,预计到2035年全世界将有5.92亿糖尿病患者,而中国的糖尿病患者将达到1.43亿。2型糖尿病(Type2 Diabetes mellitus,T2DM)占全球所有糖尿病病例的90%。肺癌是起源于支气管粘膜或腺体的恶性肿瘤,按组织病理学分为非小细胞肺癌(Non-small cell lung cancer,NSCLC)和小细胞肺癌(small celllung cancer,SCLC)。2000年全球恶性肿瘤新发病例1000万例,死亡620万例,其中肺癌新发病例123.9万例,占12.39%,死亡110万例,占17.70%。我国肺癌调整死亡率20世纪70年代为7.17/10万,90年代为15.19/10万。microRNA(miRNA)是近年来发现的一类长度约22个核苷酸的非编码小分子RNA,通过碱基互补配对的方式引起mRNA降解或翻译的抑制,在转录后水平调控基因表达。人基因组中约60%的基因都受到miRNA的调控,因而miRNA几乎参与全部的细胞进程,如调节胰岛素的生成和分泌、胰岛的发育及作用、以及参与细胞的增殖、分化、凋亡等。miRNA及其前体miRNA的变异可能会影响到miRNA的成熟过程及对下游靶基因的调控,进而影响T2DM及NSCLC的发生发展。  本研究第一部分以T2DM(738例)为病例组、健康人群(610例)为对照组;第二部分以NSCLC(283例)为病例组和健康人群(258例)为对照组作为研究对象。参照文献报道,寻找到与T2DM和NSCLC发生发展相关的9个miRNA基因。随后结合样本测序及千人基因组数据获得miRNA基因上或附近的单核苷酸多态性位点(其中T2DM的位点5个,分别是:miRNA27a的rs895819位点、miRNA124-1的rs531564位点、miRNA128-1的rs11888095位点、miRNANA194-1的rs3820455位点和miRNA146a的rs2910164位点;NSCLC的位点4个,分别是:miRNA101-2的rs462480位点、miRNA218-2的rs11134527位点、miRNA145的rs74693964位点和miRNA133 a-2的rs6062251位点)。采用TaqMan探针基因分型方法对miRNA基因9个SNPs进行基因分型,从等位基因和基因型水平分析miRNA变异与T2DM及NSCLC发生发展的相关性。Mfold在线软件预测miRNA变异位点上下游各250bp左右核苷酸序列的RNA二级结构。从miRNA变异及变异引起的二级结构改变来评估miRNA变异与T2DM及NSCLC的关系。  (1) miRNA27a的rs895819位点、miRNA128-1的rs11888095位点和miRNANA194-1的rs3820455位点等位基因频率和基因型频率差异在T2DM病例组和对照组中无统计学意义(P>0.05);miRNA124-1的rs531564位点和miRNA146a的rs2910164位点等位基因频率和基因型频率差异在T2DM病例组和对照组中有统计学意义(P<0.05)。发现miRNA124-1的rs531564位点C等位基因和miRNA146a的rs2910164位点G等位基因对T2DM具有保护作用。miRNA二级结构预测结果显示,与T2DM发生相关的miRNA124-1的rs531564 G/C和miRNA146a的rs2910164G/C变异改变miRNA的二级结构,提示这2个变异可能影响到T2DM的发生。(2)miRNA145的rs74693964位点和miRNA133a-2的rs6062251位点等位基因频率和基因型频率差异在非小细胞肺癌病例组和对照组中无统计学意义(P>0.05);miRNA101-2的rs462480位点和miRNA218-2的rs11134527位点等位基因频率和基因型频率差异在非小细胞肺癌病例组和对照组中有统计学意义(P<0.05)。发现miRNA101-2的rs462480位点的G等位基因对非小细胞肺癌的发生具有保护作用。miRNA218-2的rs11134527位点的G等位基因是非小细胞肺癌的发生风险因素。四个SNP位点的等位基因频率和基因型频率差异在腺癌组和鳞癌组中无统计学意义(P>0.05)。可见,这四个miRNA SNP位点与非小细胞肺癌的病理表型无关。miRNA218-2的rs11134527位点、miRNA145的rs74693964位点和miRNA133a-2的rs6062251位点等位频率和基因型频率差异在Ⅰ+Ⅱ与Ⅲ+Ⅳ中无统计学意义(P>0.05);miRNA101-2的rs462480位点基因型频率差异在Ⅰ+Ⅱ与Ⅲ+Ⅳ中有统计学意义(P<0.05)。miRNA二级结构预测结果显示,与非小细胞肺癌发生相关的miRNA101-2的rs462480 T/G位点和miRNA218-2的rs11134527A/G变异改变miRNA的二级结构,提示这2个变异可能影响到NSCLC的发生。  本研究发现,miRNA124-1的rs531564位点和miRNA146a的rs2910164位点与T2DM的发生相关。且miRNA124-1的rs531564位点C等位基因和miRNA146a的rs2910164位点G等位基因对T2DM具有保护作用。miRNA101-2的rs462480位点和miRNA218-2的rs11134527位点与非小细胞肺癌的发生相关,且miRNA101-2的rs462480位点与非小细胞肺癌的发展也相关。miRNA101-2的rs462480位点的G等位基因对非小细胞肺癌发生具有保护作用。miRNA218-2的rs11134527位点的G等位基因是非小细胞肺癌发生发展的风险因素。
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