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国外的最新研究表明，当今发达国家经济的主要驱动力来自创新型区域，区域自主创新是一地区经济发展的原动力。随着全球经济的高速增长，提高自主创新能力己经成为调整经济结构、转变增长方式、提高国家和区域竞争力的中心环节。如何提高区域自主创新能力以及如何构建区域创新系统已成为各个国家和地区所亟待解决的问题。近年来，作为发展中的人口大省、农业大省，河南经济实现了平稳快速增长的好现象，但是从深层次来看，这种增长主要依靠资本、劳动力、资源等要素驱动，缺乏可持续发展的深层动力。同全国相比，河南产业层次低、结构不合理，资源开发型产业比重大，产业同类化和同质化问题严重，经济增长方式比较粗放，并且由于工业化、城镇化的加快，其面临的人口多和资源环境压力比其他省份更大。因此，要想在现在的区域经济竞争中占领先机，加快从资源大省向经济强省的转变，实现河南经济社会的全面协调发展，只有不断提高区域自主创新能力。本文首先介绍了国内外关于区域自主创新的理论，并对区域自主创新的内涵及相关的概念和特点进行了重新的梳理。同时以中外研究区域自主创新的文献资源为基础，对河南省自主创新的现状和存在的问题进行了分析。其次，本文在剖析河南自主创新能力影响因素的基础上，构建了河南省自主创新能力评价指标体系（共3层23个指标）,并以主成份分析方法和模糊聚类评价方法对河南省18个地市区域自主创新进行了总和评价和定量的比较分析，对河南省2006-2009年自主创新状况进行了定量化评价，以深入了解河南省及其18地市区域自主创新能力的发展现状。最后，本文针对河南省区域创新的发展现状提出了改进河南省区域自主创新能力的发展措施。