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南海东北部营养盐时空分布其典型特征是真光层营养盐含量较低，而真光层以下营养盐含量逐渐增加，深层营养盐含量十分丰富。南海东北部海域受物理过程影响显著，在春季表层水体0-25m受到珠江冲淡水的影响，使得NOx和PO4-P的含量有所增加，但对SiO3-Si的影响不显著。SiO3-Si的高值区主要在粤东-台湾浅滩上升流影响区。此外，在黑潮入侵使得水动力条件复杂，富营养盐水发生涌升，致使营养盐含量明显增加。在营养盐的垂直分布上，由于地形的作用在陆架坡地区营养盐具有明显的爬升现象，这可能是造成陆架坡生产力较高的主要原因。南海东北部秋季营养盐分布则主要受到珠江冲淡水、及浙闽沿岸流影响明显。垂直分布上与春季相似，在地形的作用下营养盐发生抬升，但上升强度在不同断面存在一定差异。两个季节深层水体营养盐含量普遍较高，并且季节变化不明显。对珠江口不同季节的营养盐进行比较发现，珠江口处于富营养化十分严重的状态，其营养盐含量远高于与其毗邻的南海水域，每年通过径流以及冲淡水向南海排放大量的营养物质，从而对南海东北部水体中生源物质的迁移转化产生重要影响。控制珠江口污染源的排放，对于防治近海生态环境保护具有非常重要的作用。 对南海东北部沉积物-水界面之间的营养盐交换通量进行研究发现，在沉积物间隙水中，NH4-N是无机氮的主要营养成份。其中NH4-N占溶解DIN的比例为57.4％～75.1％，呈现出由近岸向远海降低的趋势，说明近岸海域的还原性较强氧化性较弱。而NO3-N、NO2-N整体上呈现出随着深度的增加含量逐渐减少的趋势，个别站位表现不明显或略有差异。SiO3-Si表现出随着深度的增加而增加，但上下层变化比较剧烈。PO4-P则大致表现为随着深度的增加先减少后增加的趋势。南海东北部海区NH4-N、NO3-N、NO2-N、PO4-P的平均交换通量分别为:8.34、1.89、-0.89、0.41μmol·m-2·d-1。总体上沉积物作为NH4-N、NO3-N和PO4-P的源，不断地向上覆水释放营养物质，从而促进陆架坡地区生产力的发展。对水交换通量的研究表明西太平洋黑潮入侵水在吕宋海峡处主要发生在500m以浅的水层，并且在300m以浅出现了明显的季节变化。总体来看，NOx和PO4-P营养盐通量秋季最强，而SiO3-Si通量则在夏季最大;整体上随着深度的增加，其营养盐输入通量先增大后减小。而在台湾海峡处终年存在营养盐的净输出，并且NOx和PO4-P在秋季输出量大于春季，而SiO3-Si通量则在夏季的输出最大。