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科技创新是一个国家想要长久发展的根本动力。高新技术企业作为一种知识密集型的经济实体,无疑成为一个国家提高综合国力,实现可持续发展和技术创新的重要推动力。因此,扶持高新技术企业发展以及完善高新技术企业的认定工作无疑成为我国政府的一项重要举措。我国政府从1991年就开始着手制定高新技术企业的认定政策,2008年科技部、财政部联合国家税务总局颁布《高新技术企业认定管理办法》从而规范了高新技术企业认定工作。获得高新技术企业资格认定不仅可以享有丰厚的国家税收优惠和地方财政补贴,同时也有利于企业通过科创板和新三板的IPO上市审核。然而,许多不满足高新技术企业认定条件的企业也企图通过管理层舞弊手段来骗取高新技术企业的认定,这些不仅引起了资本市场的动荡,同时也引起了政府有关监管部门的高度重视。审计是市场监督体系重要的制度安排,美国审计准则、国际审计准则和我国审计准则都明确指出注册会计师拥有关注管理层舞弊风险以及揭示管理层舞弊的责任。此外,中国注册会计师协会在《高新技术企业认定专项审计指引》中明确指出申报企业的管理层很有可能存在为了享受税收优惠政策的舞弊动机,导致高新技术的研究开发费用支出与高新技术产品(或服务)收入存在舞弊引起的重大错报风险,审计人员在开展高新技术企业认定审计过程中应该对于管理层舞弊风险进行评估和应对。国家审计在对于取得高新技术资格认定的企业进行复审和抽查时,也需要着重对于其是否存在管理层舞弊风险进行识别和应对。因此,审计工作如何对于高新技术企业认定中的管理层舞弊风险进行有效识别和应对的话题又一次引起人们特别的关注。本论文首先通过监管部门的结果公告以及问卷调查等方式,分析出我国当前高新技术企业认定中管理层舞弊现象较为严峻,以及在高新技术企业认定中存在一定的问题导致审计人员没有识别和发现管理层舞弊现象。其次,在国内外现有研究成果的基础上,提出了高新技术企业认定中管理层舞弊审计的策略,即以导致高新技术企业认定审计中重大错报风险的管理层舞弊风险为切入点,运用一定的审计程序和方法对于管理层舞弊的风险进行识别和应对并形成一定的合理的审计结论。然后,以A公司高新技术企业认定审计案例,详细地分析了对于A公司高新技术企业认定中管理层舞弊风险的识别和管理层舞弊风险的应对,以及对于A公司高新技术企业认定中管理层舞弊审计程序和方法从而得出合理的审计结论。最后基于全文的分析,提出了一些针对高新技术认定中管理层舞弊审计的政策性建议,如重构高新技术企业认定体系;关注高新技术企业认定中管理层舞弊的预警信号;利用投入产出逻辑图界定研究开发项目;加强对于被审单位内部控制的了解和测试;提高审计人员的执业能力;制定完善的法规标准以及现场调研和寻求专业机构的帮助等,为高新技术企业认定审计的开展提供具有实践性的建议和参考,提高审计的效率和质量,从而便于进一步规范我国高新技术企业资格认定的管理,实现资源的最优配置。