靶向测序综合分析中国非小细胞肺癌患者基因突变及探测治疗靶点

• 作 者: 陈学炜
• 机 构: 广州医科大学
• 出 处: 广州医科大学
• 发表日期: 2017年期
• 关键词: 非小细胞肺癌 综合基因组描绘 二代测序 治疗靶点

背景:目前，亚洲肺癌患者具有独特的临床特征、肿瘤组织学和不同的致癌突变倾向。对来自亚洲肺癌患者的基因组改变组成研究十分有意义。我们通过利用已经验证的二代测序方法来描绘中国肺癌患者的突变谱，利用这些信息指导治疗的策略。　　方法：我们收集自2016年6月至2016年12月期间共306例在广州医科大学附属第一医院诊治的非小细胞肺癌患者经手术切除或穿刺活检的石蜡包埋肿瘤组织样本。评估样本有足够的肿瘤细胞核后提取DNA进行扩增建立文库并在Ion Proton测序仪上进行二代测序。测序数据使用生物基因组学分析软件进行自动化分析。统计学分析使用R studio及SPSS，采用卡方检验，费希尔精确检验及T检验，P值＜0.05认为有统计学差异。　　结果：检测结果发现，在306例患者中，共145个肿瘤相关基因中发现总共845个基因组改变，每个样品的基因改变数中值为2.8个（范围，1-18个），最常见的突变基因是EGFR（46.7％），TP53（21.2％），ALK（11.7％）和KRAS（10.1％）。与癌症基因组图谱（TCGA）数据库相比，EGFR基因突变频率在本研究人群中比在欧美人群中要高得多。相比之下，KRAS基因，作为在欧美人种中第二个最常见的突变基因，在本研究人群中的突变频率仅为10.1％。在191例（62.4％）患者中检测出有与临床相关的基因组改变，其中包括68％为肺腺癌患者，38％为肺鳞状细胞癌患者。　　结论：我们的研究得出，中国人种与欧美人种非小细胞肺癌驱动突变存在显著性差异。此外，我们认为使用综合基因组描绘可以更全面地识别驱动基因组改变，这对临床治疗策略具有重要而深远的影响。