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农民专业合作社是指在家庭承包经营的基础上，从事同类或者相关农产品的生产经营者，依据加入自愿、退出自由、民主管理、盈余返还的原则，按照章程进行共同生产、经营、服务活动的互助性经济组织。
我国的农民专业合作社与国外发达国家的合作社相比，整体竞争力还不强，不同的合作社的运行状况、绩效也不同。对农民专业合作社运行绩效进行研究，对其绩效水平做出客观、正确地评价，找出其薄弱环节，并进一步采取相应措施提升我国农民专业合作社的整体竞争力，是有着十分重要的理论意义和现实意义的。
本文以扬州市为例，从农民专业合作社运行绩效及影响因素的角度出发，在理论分析合作社运行绩效的影响因素的基础上，运用功效系数法和线性回归，对扬州市农民专业合作社的运行绩效及影响因素进行了研究，最后提出了相应的政策建议。具体的内容框架为：
第一部分对研究的目标、思路以及相关概念的进行了基本阐述。第二部分是文献综述，这部分对已往农民专业合作社的研究进行了疏理，同时对绩效及其影响因素也进行了文献综述。第三部分详细考察了扬州市农民专业合作社的发展现状，并引入案例进行了分析。第四部分是对农民专业合作社运行绩效与影响因素的理论分析。第五部分，在理论分析的基础上，构建计量模型，运用所收集的数据对农民专业合作社运行绩效的影响因素进行实证分析。第六部分的内容是根据研究结果提出的政策建议。
本文实证分析部分运用了江苏省扬州市42个产销型农民专业合作社的调查数据，对构建的模型进行了回归。研究发现“人”与“资本”对合作社的运行绩效是有很大影响的；领导人能力与内部治理结构对合作社的运行绩效也有一定的影响，其中是领导人能力的影响尤为显著；政府资金的扶持对合作社运行绩效的影响不是很大。