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2006年以来，太湖富营养化问题越来越严重。蓝藻水华频发，且一年中出现水华的时间越来越长，暴发频率越来越高，造成严重生态灾难。对太湖蓝藻水华各方面研究迫在眉睫。 本论文一共对太湖三个湖区北太湖区(N2、N4、N5位点)、中南太湖(S2、S4、S5位点)、西太湖区（W2、W4位点）进行了环境因子、蓝藻时空分布的调查研究，探讨太湖富营养化基本情况，研究蓝藻与环境因子的相互关系，为太湖蓝藻水华暴发机理研究提供理论依据，对比分析蓝藻的发展趋势。根据太湖蓝藻水华水体底泥的时间空间分布趋势，为不同阶段提供更有针对性、更高效、更合理的预防措施，最大程度降低蓝藻水华的生物量，减少蓝藻水华对水源水质的影响。 实验研究表明: 1.2011.03～2012.02太湖各个湖区调查期间，北太湖区(N2、N4、N5位点)蓝藻水华生物量要明显高于其他湖区，北太湖区年平均叶绿素a含量为25.04ug/L，中南湖区为5.42ug/L，西太湖区为7.82ug/L，且暴发时间较早，一般在五月份藻类生物量骤增。同时，北太湖区水体中年平均TN、TP含量分别为2.729mg/L、0.241mg/L，明显高于中南湖区、西太湖区（中南湖区TN、TP分别为:2.08mg/L、0.191mg/L，西太湖区TN、TP含量分别为:2.302mg/L、0.234mg/L）。其中，TN含量与蓝藻空间分布呈显著相关性，TN含量与蓝藻空间分布互为因果关系。而TP含量与蓝藻空间分布相关性则不明显，主要是由于蓝藻对N和P的吸收机制不同。湖泊中P元素以颗粒态磷存在，在水体中容易沉降在湖底。当水体中P元素消耗后，沉积物会释放P进入上覆水。因此水体中TP含量相差较小。 2.太湖各湖区底泥中，从空间分布上来看，北太湖区、中南太湖、西太湖区年平均叶绿素a含量分别为1427ng/g、884ng/g、751ng/g。从时间分布上来看，秋冬季节叶绿素a含量明显高于春夏季节，蓝藻下沉越冬的时空分布与次年蓝藻水华的生态格局具有密切联系。底泥中蓝藻生物量越高的湖区、尤其越冬期间蓝藻生物量越高的湖区，次年藻类生物量增长速度越快，蓝藻暴发的时间越早。 3.通过蓝藻时空分布调查，根据太湖风场及湖流的影响，蓝藻夏季极易在北太湖区3个湖湾以及南太湖聚集，秋冬季下沉，底泥中越冬蓝藻具有明显的时空规律，为蓝藻水华的防控措施提供了新的思路。蓝藻在底泥越冬时期，处于休眠状态，其生命力最薄弱、生物量很低，对其进行种源清除，是控制次年夏季蓝藻水华暴发的有效手段。运用生态学、生物化学检测方法，对底泥表面蓝藻分布格局进行全方位的监测。通过湖泊沉积物总氮、总磷含量初步筛选和数量、种类和活性三个角度上的精确筛选，以确定整个湖泊底泥表层蓝藻种源的空间分布及越冬区域，筛选种源清除工程区域，进而对湖泊底泥表层特定位置进行种源清除。初筛蓝藻越冬种源位点北太湖区梅梁湾、贡湖湾、竺山湾、南太湖区，通过越冬蓝藻定性精确筛选，确定梅梁湾、尤其是梅梁湾西岸为进行种源清除的最佳位点。 4.采用大麦秸秆对越冬蓝藻种源进行去除。室内研究确定，大麦秸秆投入量超过1.2g/L、投入天数超过5d，对铜绿微囊藻有较好的生长抑制效果，抑藻率可达82.6％。通过越冬蓝藻种源复苏研究，大麦秸秆对越冬蓝藻种源有更好的去除效果。当大麦秸秆投入量为1.6g/L时，对底泥中越冬蓝藻种源的去除率可达42.65％。