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目的：通过研究，了解云南省艾滋病患者HIV-1毒株耐药基因型及地区和人群的分布；对云南省HIV-1毒株耐药基因亚型进行分子流行病学研究，明确云南省HIV-1病毒株流行和变异的情况；为卫生行政部门建立有效的艾滋病防控措施和制定合理的抗病毒治疗方案与疗效评估方案提供有力依据，从而控制HIV的感染与传播。方法：从2011年云南省进行艾滋病抗病毒治疗六个月以上，病毒载≥1000copies/ml的患者中进行筛选，采集全血分离血浆进行Bayer VERSANTTM440Molecular System测定病毒载量，同时采集病人的流行病学信息，分析人口学及流行病学特征，美国ABI公司9700PCR扩增仪进行反转录套式聚合酶链反应(Reverse Transcription—Polymerase Chain Reaction，RT-PCR)扩增，扩增产物送至北京博迈德公司测序，测序结果提交至美国斯坦福大学HIV耐药数据库（http://hivdb.stanford.edu）分析耐药突变情况。将所得到的序列根据美国拉莫斯国家实验室HIV核酸序列库中提供的BLAST分型分析工具对基因亚型进行分型分析。结果：624例患者样本扩增阳性，基因耐药性检测结果显示发生耐药的有280人。在280份序列中，蛋白酶抑制剂（protease inhibitors，PIs）耐药发生率为4.64%（13/280）。核苷（酸）类反转录酶抑制剂（nucleoside analogue reverse transcriptaseinhibitors,NRTIs）耐药发生率为59.29%（166/280），主要是3TC和FTC；非核苷类反转录酶抑制剂(non-nucleoside analogue reverse transcriptaseinhibitors,NNRTIs）耐药发生率为88.93%（249/280），主要是NVP和EFV；较高的耐药突变为M184V、D67N、K70R、K103N、Y181C和G190A。获得了280例耐药基因亚型，分别为127例（45.36%）为CRF08_BC亚型，56例（20.0%）为CRF01_AE亚型，27例（9.64%）为CRF07_BC亚型，27例（9.64%）为BC亚型，8例（2.86%）为B亚型，19例（6.79%）为C亚型，16例（5.71%）未知重组亚型。结论：1.本次病毒载量>1000copies的患者中，23.37%(280/1198)的抗病毒治疗患者发生耐药。其中NRTIs类药物的耐药率（166/280）小于NNRTIs类药物的耐药率（249/280）。引起NRTIs耐药变异最高的耐药突变为M184V(143例，占40.39%),引起NNRTIs耐药变异最高的耐药突变为K103N(97例，占23.20%)。随着抗病毒治疗时间的延长，HIV-1耐药相关突变还将不断积累，因此，耐药的发生是HARRT治疗失败的主要原因，这提示我们应及时进行耐药性检测，防止多药耐药和交叉耐药的出现。2.现在我国抗病毒治疗的一线方案主要还是两种NRTIs和一种NNRTIs联合用药，本研究的结果显示出现针对NNRTI的第103、181、190位点突变的率已经较高。因此，对于NNRTIs的药物耐药相关突变的重视和关注应该成为我国HAART治疗过程中的一个非常值得重视的问题。3. HIV-1耐药性检测有助于科学的选择治疗方案，在提高HARRT效果的同时，定期进行耐药性检测，能有效节约匮乏的药物资源，减少耐药毒株的流行传播。4.云南省HIV-1流行株组成复杂，不同患者体内最适合的HIV-1种群不同。且具有显著的地域特征，应密切监测。5, CRF08_BC仍然是最主要的流行亚型。