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本研究从2004年3-11月中旬，利用实地踏查、测量、观察、比较，并结合地理信息系统的空间作图等，对乌苏里江流域马圈岛普通鸬鹚的繁殖生态(包括繁殖前期、繁殖期、繁殖后期)、食性、鸣声及其繁殖生境等展开了研究。研究结果表明：普通鸬鹚每年3月下旬至4月中旬由越冬地迁回乌苏里江繁殖。4月中下旬开始筑巢，巢呈集群分布，在筑巢的同时进行交配，对旧巢的利用率达92.93％。
普通鸬鹚窝卵数多为3-4枚，通常为隔一日产一枚，卵重为52±16.85g，卵的大小为(5.84±0.28)×(3.61±0.16)cm。卵由二亲鸟共同孵化，随产随孵，雌鸟坐孵时间长于雄鸟，大多经28d孵化出壳，孵化温度为38.2℃-38.9℃，卵失重率为22.7％，孵化率为93.6％。在孵化过程中对其进行人工换卵实验，发现其对放入的异类卵没有明显的排斥现象。
普通鸬鹚刚出壳体重对它们的成长不造成任何影响。雏鸟由二亲鸟共同喂养。雏鸟1-8日龄食一些半消化的食物；8-35日龄食一些未消化的小鱼，如东北雅罗鱼、黑龙江鳑皱、唇()、蛇鮈、银鲫、鳙鱼等；35日龄以上可食较大的鱼，如长度达18cm的鲫鱼和30cm的鲶鱼等。在人工饲养条件下，雏鸟体重增长较野生条件下快，其成鸟较野外个体大。在这两种情况下，雏鸟的体重增长均呈Logistic型曲线增长。雏鸟在20日龄后体温维持在38.9±0.52℃，恒温能力晚于早成鸟。繁殖力为1.84，生产力为1.673。7月初雏鸟开始离巢，到了中旬大部分均离巢，8月上旬繁殖结束，8月中旬开始进入秋季迁徙期，至9月上旬，集大群离岛而去，最大集群数量达890只，逐步南迁。11月上旬基本迁离乌苏里江。
鸣声分析的结果表明：雏鸟的音频较成鸟高，但是持续时间较短，小于20日龄雏鸟的音节数不易分辨，雏鸟在警戒时的鸣声频率高于饥饿时的鸣声频率。
在马圈岛上，普通鸬鹚和苍鹭为优势种，白尾海雕是它们的天敌。绿头鸭和绿翅鸭为常见种，而其它的鸟类为稀有种。在普通鸬鹚生境中，筑巢柳树树高与非筑巢柳树树高差异十分显著；在普通鸬鹚巢区、苍鹭巢区、普通鸬鹚与鹭类巢混和区、普通鸬鹚与鹭类巢非分布区域各树高和胸径存在着显著的差异。
影响普通鸬鹚种群数量的因素，主要是栖息生境的破坏、江河污染、人类经济活动及天敌。另外，突发性的恶劣天气，如大风降温等，对其繁殖、生存产生极大的影响。