基于cpDNA基因间隔区序列的银叶树谱系地理学研究

来源 :中国科学院研究生院 中国科学院大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiaogege0451
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银叶树(Heritiera littoralis Dryand)是一种既能生长在潮间带,也能在陆地上生长的半红树植物,其种内系统地理分布的形成机制、系统进化关系及适应异质性生境的种群分化机制对探讨红树植物及半红树植物的起源与进化有重要意义。本研究采用cpDNA基因间隔区序列分析的方法对分布于中国、日本、越南、泰国、印度尼西亚和澳大利亚的12个地点,共17个种群进行谱系地理学研究。主要研究结果如下:   1、通过预实验对14对cpDNA引物及1对核基因单拷贝区引物进行筛选,发现仅有cpDNA的10对引物鉴别出了不同的单倍型,其中9对引物仅能鉴别出2种单倍型,且这两种单倍型区分种群的结果一致,仅accD-psaI检测出五种单倍型。因此,本研究选用accD-psaI序列用于实验分析。   2、accD-psaI引物在17个种群的124个体中共扩增出7个差异位点(3个突变位点,4个插入或缺失),构成5种单倍型。银叶树物种水平的核苷酸多态性(p)为1.15×10-3,单倍型多态性(Hd)为0.526。种群水平上,深圳盐灶种群的多态性最高(p=l.16x10-3;Hd=0.533),有两个单倍型;其次是台湾种群(2个单倍型)、印度尼西亚种群(2个单倍型,其中一个特有)和泰国Ranong种群(3个单倍型,其中2个特有),其余12个种群内均未检测出多态性(1个单倍型)。AMOVA分析结果表明银叶树种群间遗传分化程度很高(Gsr=0.739:Fst=0.823),基因流很小(Nm=O.18),这与其种群间地理隔离有关。   3、单倍型分布及系统发育分析表明,银叶树有2个广布单倍型(H1和H2)及3个特有单倍型(H3、H4和H5),其中H2是古老单倍型。泰国西海岸(Ranong)、南中国海南部(印度尼西亚)及南中国海北部的银叶树可能是不同的进化起源。南中国海南部可能是银叶树的一个起源中心或次级起源中心。失配分析和中性检验表明银叶树群体近期没有经历扩张。   4、陆生种群和潮间带种群间未检测出特有的单倍型,其进化来源有待进一步研究。   5、银叶树的保护策略应以就地保护为主,泰国Ranong和印度尼西弧均拥有特有单倍型,且二者位于红树植物的起源和进化中心,应予以优先保护。深圳盐灶种群因其古老性及高遗传多态性,也要加强保护。
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