肥胖与体重正常女性皮下脂肪组织差异microRNA的分析

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目的:肥胖发病率日益升高,给全社会带来沉重的医疗负担。microRNA (miRNA)是一组保守的非编码小RNA,可以在转录后水平对靶基因发挥负性调控作用。本文旨在研究肥胖、正常体重女性皮下脂肪组织miRNA的表达差异,探究miRNA调节肥胖发生发展的机制。方法:纳入3名肥胖女性和5名体重正常女性,中位年龄分别为40(30-56)岁和49(37-51)岁,完善临床资料、生化指标测定。取腹部皮下脂肪组织,抽提包含miRNA在内的总RNA,与Affymetrix miRNA 4.0芯片杂交,并进行差异miRNA的筛选和聚类分析。利用软件miRanda和Targetscan预测差异miRNA的靶基因,利用GO数据库和KEGG数据库对靶基因进行显著性功能分析和显著性信号通路分析。将所纳入的样本扩增为8名肥胖女性和9名体重正常女性,平均年龄分别为34.88±9.67岁和42.11±6.678岁,采用实时荧光定量PCR (qRT-PCR)方法对部分差异miRNA进行验证,并在信使RNA (mRNA)的层面检测部分靶基因在两组间的表达。结果:肥胖女性体质指数(BMI)、体重、腰围显著高于体重正常对照(P<0.05)。皮下脂肪组织miRNA芯片提示:与体重正常女性相比,肥胖女性皮下脂肪组织中共有58种miRNA出现了4倍以上的差异表达,其中,54种miRNA表达下调,4种miRNA表达上调(倍数>4,P<0.01, FDR<0.05).针对差异miRNA,采用两种不同的靶基因预测软件----miRanda和Targetscan预测出交集靶基因1333个。这些靶基因使269个功能和89条信号通路发生了显著性改变(P<0.001, FDR<0.05).其中,显著性改变程度较高的生物学功能包括:DNA的转录及其调控,细胞粘附,小分子物质代谢等。显著性改变程度较高的信号通路包括:MAPK通路、癌症相关通路、PI3K-Akt通路等。进一步,采用qRT-PCR的方法证实miR-143-3p,miR-143-5p, miR-145-5p和let-7a-5p在肥胖女性皮下脂肪组织中显著下调,表达量分别为体重正常对照的68%(P=0.046)、61%(P=0.016)、73%(P=0.042)、 66%(P=0.006),与miRNA基因芯片的检测结果一致。更进一步,对上述差异miRNA预测所得的靶基因,包括高迁移率族蛋白A2(HMGA2),Thyl细胞表面抗原(THY1)、Tar DNA结合蛋白(TARDBP)、衔接因子蛋白含pH域磷酸酪氨酸结合域和亮氨酸拉链基元1(APPL1)、脂肪酸转运蛋白-1(FATP1)、葡萄糖磷酸变位酶3(PGM3)的mRNA水平进行了研究,结果发现let-7a-5p调控的靶基因HMGA2在肥胖女性皮下脂肪组织中表达明显增加,是体重正常女性的3.19倍(P=0.025)。结论:肥胖女性的皮下脂肪组织中58种miRNA出现了4倍以上的差异表达,其中,93%(54/58)的差异miRNA表达下调,7%(4/58)的差异miRNA表达上调,这些差异miRNA预测调节的靶基因主要参与DNA的转录及其调控等生物学功能和MAPK等信号通路. qRT-PCR的方法证实4种差异miRNA:miR-143-3p, miR-143-5p, miR-145-5p, let-7a-5p在肥胖女性皮下脂肪组织中显著下调,let-7a-5p的靶基因HMGA2在肥胖女性皮下脂肪组织表达明显增加,它们可作为肥胖患者脂肪组织的生物标记和潜在的减肥治疗靶点。
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