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第一部分 Arkadia是一种含有Really Interesting New Gene(RING)结构域的E3泛素连接酶。Arkadia通过泛素化降解转化生长因子β(Transforming growth factor-beta，TGF-β)信号通路中的抑制因子，活化TGF-β信号通路。对于Arkadia蛋白是如何被调控却知之甚少，我们的研究表明FHL2蛋白可以和Arkadia发生相互作用，增强Smad3/Smad4依赖的下游基因的转录。通过RNA干扰下调细胞内FHL2的水平，Arkadia蛋白水平也被下调，TGF-β信号通路下游基因的表达也受到抑制。我们发现Arkadia多泛素化修饰发生在第27位和第63位的赖氨酸(K)残基上。RING结构域的单个氨基酸突变使得Arkadia丧失其泛素连接酶活性，说明Arkadia发生自泛素化修饰。进一步研究发现碳端突变的Arkadia不能发生K27位泛素化修饰，而K63位泛素化修饰不受影响，而突变蛋白的稳定性增强，这说明影响Arkadia稳定性的泛素化修饰发生在K27位。当FHL2和Arkadia相互作用时，泛素化修饰被抑制的Arkadia半衰期得到延长，TGF-β通路能被更加持久的活化。综上，我们的研究发现了一个新的Arkadia泛素化修饰调控机制，并证实FHL2通过该机制调控TGF-β信号通路活性。 第二部分 原发性肝细胞癌是一组高度异质性的肿瘤组成，由不同的致病因子和遗传变异所致。慢性乙型肝炎是主要的原发性肝细胞癌致病因子，多发于男性，而中国是主要的慢性乙型肝炎流行地区，这导致我国多数原发性肝细胞癌患者是有慢性乙型肝炎病史的男性患者。通过研究转录组-基因型-临床表现之间的相关性，可对慢性乙型肝炎相关原发性肝细胞癌，在分子水平更好的分型。基于100例男性慢性乙型肝炎相关原发性肝细胞癌组织，6例瘤旁对照组织，4组正常肝细胞组织库的转录组数据，通过非监督聚类分析的方法，我们将慢性乙型肝炎相关原发性肝细胞癌细分成三个亚组（A组，B组和C组），各组有着特征性的临床表现和遗传特征。A组病例有较好的预后表现，而B组肿瘤组织中TP53突变的频率更高，C组病例则通常血清甲胎蛋白含量较高，分化水平较差。为了便于HCC分型，我们建立了一种基于15个基因表达水平、可通过定量反转录PCR检测的分型方法，适用于临床检验。 结论:本研究建立了一种新的慢性乙型肝炎相关原发性肝细胞癌分型方法，这可以帮助我们更好的理解人类慢性乙型肝炎相关原发性肝细胞癌。