系统性红斑狼疮患者外周血白细胞群体的RNA编辑变化研究

来源 :中国科学院大学(中国科学院上海巴斯德研究所) | 被引量 : 0次 | 上传用户:xingxing7978
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RNA编辑是一种将原来存储在DNA中的遗传信息进行转录后修饰或共转录修饰的过程。在不改变原有DNA序列信息的情况下,RNA编辑增加了转录组的多样性和灵活性,丰富了转录组的信息。包括病毒在内,在几乎所有生物中都发现了不同类型的RNA编辑。在人体内,许多研究观察到了丰富的RNA编辑事件。有研究表明适当水平的RNA编辑是生物所需要的,它能够防止内源性双链RNA被免疫系统错误的识别为非自身。研究发现有两个蛋白家族通过脱氨基作用介导了RNA编辑,一个是介导腺嘌呤脱氨基形成次黄嘌呤的双链RNA脱氨酶ADAR蛋白家族,一个是介导胞嘧啶脱氨基形成尿嘧啶的载脂蛋白B mRNA编辑复合物APOBEC蛋白家族。系统性红斑狼疮是一种严重危害人类健康的慢性复杂的自身免疫性疾病。患者可能在免疫级联的许多部分中发生缺陷,导致患者的临床症状具有异质性,给疾病诊断带来挑战。新一代测序技术的出现使研究者能够在整个转录组的层面研究系统性红斑狼疮的疾病特征。有研究显示系统性红斑狼疮患者的外周血样本中存在比健康个体更高的RNA编辑水平,由此推测,差异明显的RNA编辑增加了患者体内的新抗原,给患者的免疫系统带来压力。外周血是多种细胞的混合物,探明血液细胞中具体是哪一种细胞具有高水平的RNA编辑对于从转录组水平解释系统性红斑狼疮的发病机制具有一定意义,也能为疾病治疗提供参考依据。我们选择了外周血单个核细胞、低密度中性粒细胞、浆细胞样树突细胞以及T淋巴细胞四种细胞分析它们的RNA编辑事件情况。其中,外周血单个核细胞包含大量淋巴细胞,低密度中性粒细胞具有增强炎症的作用,浆细胞样树突细胞在血细胞中比例小但是处于内源性免疫和适应性免疫交叉点,T细胞在SLE自身免疫反应的启动、维持以及器官损害方面发挥着重要作用。我们的工作研究它们的RNA编辑模式以验证是否外周血的这部分白细胞群体都具有比健康个体更高的RNA编辑水平。我们的研究结果显示,外周血单个核细胞的RNA编辑水平在患者和健康个体间确实存在差异,编辑水平差异的基因可以富集在能够影响小核核糖核蛋白生物发生的细胞成分,pro-T细胞向alpha-beta T cell分化的生物过程以及一型单纯疱疹病毒感染的生物学进程的通路上。但是并不是所有的白细胞都有相同的RNA编辑模式,低密度中性粒细胞的编辑水平在患者和健康个体中并没有表现出差异。浆细胞样树突细胞的RNA编辑水平在患者和健康个体中虽没有显著性差异,但是患者组的RNA编辑水平却略低于健康个体组,推测可能以不同于外周血单个核细胞的RNA编辑模式影响疾病的发生和维持。T细胞的编辑水平在患者中的变化范围大于健康人群,推测T细胞不同亚群的编辑水平可能存在差异。我们的研究并未能探明RNA编辑在系统性红斑狼疮发生和持续中的明确作用机制,但是对于深入研究特定细胞中的RNA编辑状态与系统性红斑狼疮发生维持的联系具有一定参考意义。
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