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按照俄国理论家巴赫金的对话理论和间性理论，我们可以把生物学哲学理解为生物学与哲学的对话性的理论构成，是一种涉足于生物学和哲学之间的间性理论。巴赫金理论突破了西方长期以来的逻各斯中心主义的理性规范，在逻各斯规范的分类体系中寻找各个不同类属的事物、话语之间的对话联系、间性联系，提出了对近代学术学科分类框架进行解构和重组的设想。 生物学哲学的创新性就在于它在生物学与哲学两种不同学科的交流、对话空间中，发现了一种“间性”，提出了一种研究生物学和研究哲学的新思路、新规范、新视角。生物学哲学研究生物系统产生、发展过程中出现的哲学属性和规律性，具体研究生物机体结构和功能的一般规律及其在与环境相互作用中发展的一般规律以及哲学的普遍规律在生物系统中的一般形式。分子生物学理论和技术的出现与发展促使生物学哲学这一跨学科研究的出现和发展。 以二者对话为中心，进行分子生物学与哲学间性研究，需要在一定的对话理论和间性理论基础上建立起分子生物学和哲学的对话联系、间性联系。同时，研究分子生物学和哲学间性问题，需要了解分子生物学的发展史。当生命科学研究从宏观生物圈发展到微观分子水平时，研究结论反馈出的生命本质的规律性和宏观世界的哲学规律性高度统一，哲学中的整体性学说、水平学说、矛盾的对立统一规律、否定之否定规律、量变和质变规律在生命科学发展中得到体现，在分子生物学核心理论（中心法则，顺式作用元件和反式调控因子相互作用）中获得生命领域新的价值和意义。研究分子生物学和哲学间性问题不仅要把握生命科学的发展，还要掌握相关的哲学观念。 本论文以分子生物学发展史为纵向，以生命科学发展中所体现和深化的哲学规律结合哲学史中的相关哲学论说为平面交织而成论文结构。论文具体内容包括分子生物学和哲学间性研究的目的、意义和研究现状，二者关于生命起源和生命本质问题的对话，关于整体性问题及其结构水平学说的对话，以及分子生物学和自然辩证法之间的对话。 对生物学哲学问题的研究有助于生命科学工作者从哲学的高度认识科学问题，指导研究工作。因为生命科学的发展不仅取决于技术的进步，也取决于科学工作者所选择的世界观和方法论。通过对分子生物学研究中哲学问题的探讨，我试图建立起对生命科学和哲学两者认识上的联系，从而帮助生命科学工作者形成相对整体的认知系统，以便更好地利用先进的生物技术改造我们的生活。 每一个新的时代都有产生新的哲学概括的需要，但是一种新的理论形态的诞生和合法性存在，必须有一定的科学依据。很多学者认为生物学哲学是一门交叉学科和边缘学科，这种交叉性和边缘性就是巴赫金所说的“间性”。对“间性”的认识和发现，是当代学术发展、创新的一个突破口。