【摘 要】
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目的:检测人类子宫内膜着床窗口期miRNA表达谱,建立miRNA参与调控胚胎着床的生物信息网络。方法:双通道微阵列技术检测人类子宫内膜着床窗口期miRNA表达谱,应用MMIA在线服务
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目的:检测人类子宫内膜着床窗口期miRNA表达谱,建立miRNA参与调控胚胎着床的生物信息网络。方法:双通道微阵列技术检测人类子宫内膜着床窗口期miRNA表达谱,应用MMIA在线服务器进行靶mRNA基因预测,用Cytoscape软件构建由miRNAs和mRNAs组成的生物信息网络,通过MAS在线服务器对生物信息网络中差异表达mRNAs基因进行功能分类,预测miRNA参与调控胚胎着床的关键分子通路。结果:1.着床窗口期有72个miRNAs差异表达,其中50个显著上调,22个显著下调(fold change =2, q value< 0.01);2.除去23种miRNAs未能预测到靶基因外,余下49种miRNAs预测到6106种拥有唯一官方基因符号的靶mRNAs基因。对于每个差异表达的miRNA来说,预测mRNAs靶基因的数量存在较大差异;3.筛选出着床窗口期差异表达的miRNAs和差异表达的预测靶mRNAs基因(fold change =2.5, p value< 0.01),满足上述条件的共有218个基因构成生物信息网络,其中39个miRNAs上调,6个miRNAs下调,114个mRNAs上调,59个mRNAs下调。结论:微阵列技术和计算机方法能有效分析着床窗期基因表达,为研究调控胚胎着床的分子机制提供了重要参考。
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