分枝杆菌Rv0164及MSMEG_0129结构的初步研究

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结核病是由结核分枝杆菌引起的慢性传染病。据世界卫生组织报道,2015年,全世界新发结核病数量约为1040万例,并有180万人死于结核病。耐药性结核、HIV共感染以及缺乏有效的疫苗,使结核病成为严重的公共卫生威胁。  Rv0164是结核分枝杆菌H37Rv标准株的一个假想蛋白,并且在分枝杆菌属中具有保守性。Rv0164是H37Rv生长的必须基因。Rv0164被鉴定为T细胞抗原,可诱导人外周血单核细胞产生IFN-γ。通过对结核分枝杆菌毒株H37Rv与弱毒株H37Ra的转录组和蛋白组的比较,发现Rv0164的表达量在两者间均存在显著差异,因此推测该蛋白可能与毒力相关。MSMEG_0129是Rv0164在耻垢分枝杆菌中的同源蛋白,两者相似度为59%。它们都被预测为聚酮类化合物环化酶/脱氢酶家族,参与聚酮类化合物的合成。聚酮类化合物环化酶在细菌线性聚-β-酮中间产物的环化过程中发挥着重要功能。分枝杆菌聚酮合酶(polyketidesynthases,PKSs)参与分枝杆菌细胞壁复杂的脂类及糖脂的生物合成,与毒力相关。迄今为止,在分枝杆菌中,Ⅱ型PKSs尚未见报道,Ⅱ型聚酮类化合物环化酶的结构及作用机制也尚不清楚。  本研究表达并纯化了Rv0164与MSMEG_0129,获得了分辨率4(A)的Rv0164蛋白晶体及分辨率1.9(A)的MSMEG_0129蛋白晶体,并解析出MSMEG_0129蛋白的三维结构。MSMEG0129的结构具有helix-grip折叠类型,包括7个反向平行的β折叠,一个长的C端α螺旋以及2个小的α螺旋,并且在结构的内部形成一个可结合配体或者底物的疏水口袋。MSMEG_0129结构的解析为MSMEG_0129及Rv0164的进一步生物学功能研究,及分枝杆菌Ⅱ型PKSs的研究奠定了基础。
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