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在世界经济整体持续下行及中国经济迈入新常态背景下，实现结构转型及发展动力转换是促进中国经济持续中高速增长的不二选择。结构转型的关键在于制造业，转换发展动力的根本在于创新和研发，由此增加制造业研发投入并提高其投资效率是迎接所有挑战的客观需要。德国工业4.0、美国再工业化及《中国制造2025》无不强调制造业研发投资的重要性。 迄今为止，虽然中国针对制造业出台了一系列支持性政策措施，对研发创新起到一定的促进作用。但由于融资约束的存在，依然限制着制造业创新。而融资约束存在的必然结果就是使得制造业研发投资效率损失。中国非上市规模以上制造业研发投资效率是否因融资约束和不确定性而存在效率损失？如果存在，其损失为多少？这种损失在不同规模企业、不同地区之间是否有差异？既有研究对此问题关注尚显不足。本文基于中国工业企业数据库数据，运用异质性随机前沿模型，定量分析在融资约束和不确定性条件下，中国非上市规模以上制造业研发投资效率问题，为提高制造业研发投资效率提供依据。 本文研究发现，研发投资由于受融资约束的影响，中国非上市规模以上制造业平均研发投资效率仅为59％，比最优前沿效率低了40％左右。制造业研发投资的资金主要来源于内源融资，内源融资中的自由现金流虽然可以起到缓解融资约束的作用，但又会增加后续融资的不确定性;销售净利率既能够缓解融资约束，且不会增加后续融资的不确定性;外源融资中的银行贷款并不是主要融资渠道，银行贷款虽然不能够缓解融资约束但可以降低融资的不确定性;商业信用融资既可以降低融资约束，又不会增加不确定性;小规模和西部地区企业受到融资约束更严重。政府要通过金融发展与改革，提高企业盈利能力，增加内部现金流以解决企业研发投资中的融资约束问题。 因此，本文围绕融资约束及其不确定性对企业研发投资效率的影响，基于工业企业数据库数据进行实证，文章一共由六个部分组成。 第一部分，绪论。阐述了文章研究背景、研究意义、研究内容和研究方法、可能创新与不足以及本文所要研究的问题。 第二部分，文献综述。从企业非融资方面的影响因素（政府补助、市场结构、高管特征、公司治理）和融资方面的影响因素（内源融资、负债融资、商业信用融资、权益融资）来分析影响研发投资效率的因素。分析在融资约束下研发投资效率问题、融资约束对研发投资效率的影响机理以及现有研究的不足。 第三部分，模型思想分析。对随机前沿函数和双边随机前沿函数以及异质性随机前沿函数进行思想分析，为后文的实证研究建立理论基础。 第四部分，模型设计和变量度量。对异质性随机前沿模型进行设计、对前沿效率、融资约束和不确定性进行衡量以及说明数据来源。 第五部分，通过构建异质性随机前沿函数对中国制造业研发投资效率进行实证分析。 第六部分，结论和政策建议以及对未来研究的展望。对实证结果进行总结归纳，并对未来可能的相关研究方向进行展望。