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马铃薯是重要的粮菜兼用作物。马铃薯在生产过程中受到各种病虫的危害，其中由青枯病菌（Ralstonia solanacearum）引起的马铃薯青枯病是马铃薯的严重危害，研究和探讨我国存在的青枯病菌生理小种和生化变种，了解青枯病菌的遗传多样性，是有效防治青枯病的基础。
本实验根据已测序马铃薯青枯病菌小种3号菌株的基因组序列，从设计的近200对SSR引物中经初步筛选获得了120对SSR引物，并对我国11个省（市）的28个植物青枯病菌菌株和2个国外青枯病菌菌株进行了PCR扩增，主要结果如下：
1.在120对SSR引物中有110对引物表现出了多态性，其中SSR10288、SSR10305、SSR10307多态性很强。
2.供试菌株被聚类为四组：A组中包含了来自我国不同地区的15个青枯病菌，寄主均为马铃薯，属于生理小种3号；B组中包含有来自不同地区、不同寄主的9个青枯病菌，寄主分别有番茄、花生、茄子、辣椒和甘薯，属于生理小种1号；C组仅有1个香蕉青枯病菌，属于生理小种2号；D组包含来自不同地区的5个生姜青枯病菌，属于生理小种4号。
3.本实验SSR聚类结果表明，青枯病菌的遗传多样性与地理来源关系不明显，而与生理小种的划分有关。因此，可以利用本实验的SSR引物直接对情况病菌的基因组DNA进行扩增对菌株进行初步分类，这为建立马铃薯青枯病菌监测体系奠定了基础。