亚细胞蛋白质组学研究的策略——大鼠肝组织线粒体蛋白质组学研究

来源 :中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所 中国科学院上海生命科学研究院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:tc13709479876
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为高通量、高质量地确定线粒体蛋白质组成,本文分别采用减数蛋白质组学、比较蛋白质组学、多元化蛋白质组学和生物信息学预测软件联用等策略,比较分析不同纯度的大鼠肝组织线粒体。通过多维色谱串联质谱技术建立了目前最大的含227种大鼠蛋白质的线粒体蛋白质组学数据库。首次建立了大鼠肝组织线粒体磷酸化蛋白质和糖基化蛋白质的双向凝胶电泳图谱,并发现线粒体中10余种代谢酶类蛋白质存在多种磷酸化或糖基化翻译后修饰形式。进一步的研究表明,比较蛋白质组学与生物信息学预测软件联用等策略相结合,非常有效地将真正线粒体蛋白质与其它细胞器污染蛋白质甚至多亚细胞定位蛋白质区别开。一些未知蛋白质、无定位信息已知蛋白质、甚至其他定位蛋白质被强烈暗示在大鼠肝组织线粒体中定位。其中,一直被认为是过氧化物酶体标志性蛋白质的过氧化氢酶,经蛋白质组学分析,被提示可能以多种磷酸化形式存在于大鼠肝组织线粒体。
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