正相杂交型SNP检测芯片用于近交系小鼠遗传监测

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运用基于芯片的双色荧光正相杂交检测SNP技术,在一张芯片上针对同一SNP位点实现个体数目的高通量检测,达到大规模近交系小鼠遗传监测的目的。首先进行芯片杂交动力学研究,考察信号值和Ratio值与PCR产物点样浓度、PCR产物长度和荧光标记探针长度之间的关系,探讨这三者对SNP分型的影响;然后参考数据库信息,选择合适的参数,对主要来源于4个近交系小鼠品系的多个基因组DNA样本进行SNP分型,整合5个SNP位点的芯片杂交信息,对样本所属品系进行判断。结果表明基于芯片的双色荧光检测SNP系统能够对选定的5个SNP位点进行高准确率分型。我们得出结论该项SNP分型技术适合于对少量近交系品系来源的大样本量小鼠进行遗传污染监测和品系鉴定,并具有扩大应用的潜力。
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