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目的：本研究通过对进展期胃癌患者和健康人血清的血清肽谱比较研究，为胃癌早期诊断提供实验依据，并可能应用于胃癌的疗效评价和复发监测。 方法：使用三种常用的磁珠，包括固定化金属离子亲和层析磁珠（MB-IMAC Cu）、弱阳离子磁珠（MB-WCX）、反相碳18磁珠（MB-RPC18）对血清低分子蛋白质/肽的提取效果，筛选相对适合的磁珠分离提取血清低分子蛋白质/肽用于进一步的质谱分析。收集了年龄和性别相匹配的30例健康人血清和30例进展期胃癌患者血清，使用WCX磁珠提取血清肽与MALDI-TOF质谱检测血清肽相结合的方法，获得健康人血清肽谱和胃癌血清肽谱，对二组血清肽谱进行比较分析，获得差异表达血清肽；通过对差异肽对诊断胃癌效率的分析，建立基于差异肽的诊断胃癌模型，进行外部验证；使用CEA、CA19-9免疫检测试剂盒检测血清样本中CEA和CA19-9，通过血清肽诊断胃癌模型及与CEA、CA19-9的诊断效率分析比较，进一步检验诊断模型的诊断可靠性。 结果：三种磁珠结合MALDI-TOF质谱检测显示：MB-WCX提取的血清肽具有最好的肽峰分布和较高的峰数量，更适合用于血清预处理；通过对基于MB-WCX和MALDI-TOF质谱技术的健康人和胃癌血清肽谱比较分析，筛选到分子量为2863Da和2953Da的两个肽峰在胃癌血清中表达明显升高，分子量为1945Da和2082Da的两个肽峰胃癌血清中表达明显下降；对每个肽峰作为诊断标志物诊断胃癌的效率进行分析，发现2953Da和1945Da具有较高的灵敏度和特异性；选择2953Da和1945Da两个肽峰，利用2953Da/1945Da为参数建立血清肽诊断胃癌模型；外部验证显示，该诊断模型诊断胃癌的灵敏度和特异性达90.0％。通过检测显示健康人血清CEA和CA19-9阳性率分别为16.7%和20.0%，胃癌患者血清CEA和CA19-9阳性率分别为73.3%和63.3%，CEA和CA19-9在二组中的阳性率皆有差异显著性，P＜0.05。通过血清肽诊断胃癌模型与CEA和CA19-9诊断效率综合分析比较，P＜0.05，显示血清肽诊断胃癌模型具有更高的灵敏度和特异性。 结论：MB-WCX更适合用于提取血清肽；进展期胃癌患者与健康人的血清肽谱存在一定差异；基于2953Da和1945Da的血清肽诊断模型对进展期胃癌具有较高的诊断效率。