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目的:本研究主要分析了乳腺癌与TNRC9 rs12443621、LSP1 rs3817198基因位点的相关性,探讨乳腺癌的遗传背景及发病机制,旨在从生物学机制方面对女性乳腺癌病因学进行探讨,同时调查黑龙江地区女性乳腺癌遗传度及其相关危险因素情况。为乳腺癌的三级预防提供线索,并为乳腺癌高危人群筛查和防治提供理论依据。
方法:1.收集所有参与实验患者外周血,提取DNA,根据Easton通过全基因组相关研究发现并发表于2007年Nature的与乳腺癌发病相关的基因TNRC9、LSP1基因的2个SNP位点分别设计1对PCR引物和TaqMan探针,进行实时荧光PCR扩增,对各位点进行分型。
2.采用病例一对照的方法,对105例乳腺癌患者和382例健康妇女进行研究,分析年龄等临床因素对乳腺癌患病风险的影响及TNRC9 rs124436211、LSP1rs3817198基因型分布、采用Logistic回归分析计算,用OR值及CI值进一步估计并阐明位点SNP与乳腺癌发病风险之间的关系。
结果:1.病例对照基本信息和环境危险因素比较分析
本研究共获得有效样本487例,其中乳腺癌病例105例,对照例382例。病例组与对照组的平均年龄相似,分别为51.28±11.29岁和49.91±4.02岁,无统计学意义(P=2.806)。病例组的初潮年龄小于对照组(P=0.022),本次研究中未发现绝经年龄与乳腺癌的发病危险性有关。生殖的因素中,对照组的母乳喂养史较病例组时间长;病例组中,无母乳喂养史者与乳腺癌发病相关(P=0.009)。对照组和病例组有生育史的比例均较高,分别为91.43%和96.6%,病例组中无生育史者比例较对照组高与本研究所来源人群乳腺癌发病有统计学意义(P=0.006)。未发现流产史与本研究中人群乳腺癌的发病危险性有关。
2.TNRC9 rs12443621以及LSP1 rs3817198基因型与乳腺癌易感性分析
2.1本研究共收集487例样本,在正常对照组中,TNRC9 rs12443621 G以及LSP1 rs3817198 C等位基因频率分别为0.219和0.166;在病例组中等位基因频率分别为和0.176和0.104。
2.2 TNRC9 rS12443621多态位点的基因型频率分布在病例组和对照组之间差异均有统计学意义(P=0.017)。结果显示与TNRC9 rs12443621野生型纯合子相比,变异型杂合子(AG)和变异性纯合子(GG)均与乳腺癌的发病危险性相关(AG基因型OR=2.017,95%CI=0.910-4.471;GG基因型OR=2.684,95%CI=1.318-5.463),其变异基因型可显著增加乳腺癌的患病风险。采用多因素Logistic回归对年龄、月经初潮年龄、绝经状况、哺乳史、生育史进行调整计算TNRC9 rs12443621变异基因型致乳腺癌的发病风险性,发现TNRC9 rs12443621多态性与乳腺癌危险性之间存在统计学关联,其变异基因型可显著增加乳腺癌的患病风险(AG基因型的调整OR=0.621,95%CI=0.075-5.129;GG基因型的调整OR=1.569,95%CI=0.233-10.556)。
2.3 LSP1 rs3817198位点的基因型分布在病例和对照组间均没有统计学差异(P=0.116),与乳腺癌的发病不相关。
结论:病例对照组研究中单因素Logistic回归分析均显示,无生育史为乳腺癌的危险因素,而哺乳时间长、初潮年龄晚、生产数多则为乳腺癌的保护因素,未发现绝经年龄与乳腺癌的发病危险有关。
1.TNRC9在本地区女性乳腺癌的发生发展中可能起重要作用,基因的遗传多态性可增加中国东北地区女性罹患乳腺癌的危险性,其可作为检测中国妇女乳腺癌异感性的重要生物标志物。
2.随机选取10个样品,对2个位点进行PCR产物测序,测序结果表明,本实验中SNP的检测采用的Taqman探针检测法检测突变位点碱基针对性更强,可信度较高。