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岩羊(Pseudois nayaur)是我国二级保护野生动物,具有重要的生态和经济价值。本研究共采集了124个组织样本,根据其地理分布位置,划分为贺兰山、四川、甘肃、青海、新疆、西藏6个种群。我们选用12个微卫星位点(SRCRSP3、ILSTS30、TCRVB6, LSCV36、ILSTS058、INRABERN185、OarFCB304、ILSTS019、LSCV105、LSCV116、 LSCV06和ETH10)对岩羊进行种群遗传学分析,主要分析种群间的等位基因(NA)、有效等位基因(NE)、杂合度(H)、多态信息含量(PIC)、基因分化系数(FST)、基因流(NM),根据Nei’s DA遗传距离构建群体和个体NJ系统树,并通过贝叶斯聚类分析方法用STRUCTURE软件来推导种群的遗传结构,得出以下研究结果：1.12个位点共检测到183个等位基因,各位点等位基因数最低为7个,最高为22个,平均为15.25,平均有效等位基因为7.20；平均多态信息含量(PIC)的值为0.84。所有位点的观测杂合度(HO)介于0.37-0.80之间,均值为0.60；期望杂合度(HE)介于0.76-0.91之间,均值为0.86。2.12个多态位点的Hardy-Weinberg平衡检验结果显示：位点SRCRSP3、LSCV36, INRABERN18, OarFCB304、LSCV116和ETH1O在6个种群的检验结果完全或基本符合哈温平衡(P>0.05),位点TCRVB6在三个种群中处于不平衡状态,其余5个位点只在某一个种群中偏离平衡。不平衡可能与每个种群的样本数有关,也可能存在无效等位基因。3.通过基因分化系数(FsT)的结果,可以看出贺兰山种群与其他5个种群的平均基因分化系数为0.37,大于西藏种群与任意种群的分化系数,在NJ树上单独聚为一枝,支持贺兰山种群作为岩羊第三亚种的观点。