春石斛兰SSR遗传图谱构建

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石斛属(Dendrobium)为兰科最大的属之一,属附生兰类,多年生草本植物。全球约1600种,主要分布于热带亚洲和太平洋岛屿,具有重要的药用价值和观赏价值。  本文以日本引进的两个春石斛品种Den.025(Dendrobium Second Love),Den.028(Dendrobium Sekand Rave)为亲本材料,以Den.025(♀)×Den.028(♂)及Den.028(♀)×Den.025(♂)产生的F1代为作图群体,随机选择92个杂交F1单株为实验材料,采用SSR分子标记技术,建立了春石斛形态特征以及分子标记聚类分析树状图,并且成功构建了春石斛的分子遗传图谱。主要结果如下:  1、对春石斛Den.025和Den.028用300对SSR引物组合进行筛选,获得扩增稳定、带型清晰的SSR引物70对,共获得多态性标记427个,平均每对引物组合产生6.1个多态性位点。其中Den.025特有标记187个,Den.028特有标记120个,亲本Den.025和Den.028共有标记120个。  2、根据植株的叶长等5个数量性状和花瓣端部颜色等6个质量性状,对Den.025(♀)×Den.028(♂)及Den.028(♀)×Den.025(♂)F1代群体进行了UPGMA聚类分析;采用427个SSR多态性标记,分别对Den.025(♀)×Den.028(♂)及Den.028(♀)×Den.025(♂)子代群体进行了UPGMA聚类分析。通过比较F1代群体在基于形态性状与分子标记的聚类分析树状图中的分布,分析得出基于形态性状聚类分析与分子标记的聚类分析结果基本一致,且不论是基于形态性状聚类分析还是分子标记的聚类分析,可以看出,花色是导致群体在聚类中分布的主要因素。  3、分别构建了Den.025和Den.028的分子遗传图谱。Den.025中,用JoinMap4.0软件对307个分离位点进行运算,最终形成12个连锁群,共124个标记位点;覆盖总图距571.0 cM,位点间平均遗传距离为4.6 cM,连锁群平均长度为47.6 cM,每个连锁群平均包含10.3个标记位点;12个连锁群中,位点数最多的连锁群(Den.025-1)含有84个标记,也是最长的连锁群,覆盖图距为188.2cM,最短的连锁群(Den.025-11)覆盖图距为16.6 cM;连锁群中标记间最大的遗传距离是43.4 cM(连锁群Den.025-1),最小的遗传距离是0.1 cM(连锁群Den.025-1)。  Den.028中,用JoinMap4.0软件对240个分离位点进行运算,最终形成10个连锁群,共67个标记位点;覆盖总图距566.3 cM,位点间平均遗传距离为8.5 cM,连锁群平均长度为56.6 cM,每个连锁群平均包含6.7个标记位点;10个连锁群中,位点数最多的连锁群(Den.028-1)含有39个标记,也是最长的连锁群,覆盖图距为218.4 eM,最短的连锁群(Den.028-8)覆盖图距为15.1 cM;连锁群中标记间最大的遗传距离是52.8 cM(Den.028-5),最小的遗传距离是0.4 cM(连锁群Den.028-8)。
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