【摘 要】
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拟南芥全基因组测序的完成给我们破解拟南芥中大量基因的信息提供了机会和挑战,认识这些基因最为重要的一步便是确定哪些基因表达及它们的表达是如何被调节的.DNA微阵列技术
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拟南芥全基因组测序的完成给我们破解拟南芥中大量基因的信息提供了机会和挑战,认识这些基因最为重要的一步便是确定哪些基因表达及它们的表达是如何被调节的.DNA微阵列技术让这一切成为可能,它可以高通量地检测基因组大量基因的表达.转录因子是拟南芥基因组中具有重要功能的一类基因,它能调节靶基因的表达,所有转录因子表达谱在一定程度上反映了整个基因组的转录活动.所以,在基因组中研究转录因子如何表达和如何调节是很有价值的.我们在得到拟南芥所有已知和预测的1864个转录因子的序列后,利用设计的引物通过PCR扩增出每个基因的DNA片断并制成cDNA微阵列芯片.通过芯片杂交我们检测了拟南芥幼苗的转录因子表达,和在光调控下的表达.结果发现,生长六天的拟南芥幼苗中有1377个转录因子在白光下表达,有1241个在黑暗中表达,所有表达的基因占整个转录因子的84﹪.同时我们还进一步检测了在暗中生长的幼苗对蓝光的反应和特异光受体在蓝光调节中的作用.实验结果表明有20﹪的转录因子对蓝光有反应,其中249个是正调控,115个是负调控.大部分受蓝光调节的转录因子对蓝光的反应极为迅速,快于受蓝光调节的其它类基因.这一点也证实了转录因子在对蓝光的反应中具有调节其它基因反应的功能.另外我们还比较分析了野生型拟南芥幼苗和几种光受体突变体在蓝光下的表达,证实了隐花色素是蓝光的主要受体,而光敏色素A和趋光色素在这里作用不大.
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