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根据联合国粮农组织(FAO)和国际动物遗传学会(ISAG)联合推荐的27对猪微卫星引物，通过查阅有关资料从中筛选出能用于贵州地方猪研究的6对引物(S0155，SW240，IGF1，SW951，SW857，SW24)，用以对糯谷猪等3个贵州地方猪群体进行了微卫星DNA检测，进而对糯谷猪等三个地方猪种资源进行遗传多样性研究分析，从而为糯谷猪的品种鉴定，保护，开发利用提供依据。得到主要结果如下：1、从3个贵州地方猪群体的6个微卫星座位上共检测到43个等位基因，其中共享等位基因16个，非共享等位基因27。各等位基因频率介于0．0089-0．5241。2、3个群体在6个微卫星座位上的多态座位百分比均达100％，其观察杂合度、期望杂合度、NEI氏期望杂合度分别为0．9278±0．2109、0．7987±0．0294、0．7975±0．0287，平均杂合度0．7605±0．0318。3、本研究得到的糯谷猪的平均基因多样性(GD=0．707)和Shannon指数(SI=1．431)在三种猪中是最高的，三品种(类型)猪GD在0．611-0．689之间，SI在1.112-1．342之间；平均有效等位基因5．3±0．9513个，平均多态信息含量(PIC)0．7196±0．0417，三品种(类型)猪呈高度多态(PIC>0．5)，说明贵州地方猪遗传多样性十分丰富。4、本研究得到的NEI氏标准遗传距离介于0．2063-0．4815，群体间遗传距离最远的是关岭猪与糯谷猪，最近的是柯乐猪与糯谷猪。遗传相似系数则介于0．7346-0．90505、综合群体遗传多样性的五个指标：平均等位基因数，有效等位基因数，基因多样性，多态信息含量和Shannon指数可知，群体遗传变异与大到小排列顺序为：关岭猪，柯乐猪，糯谷猪。根据奈氏遗传距离及奈氏标准距离，绘制三种(类型)猪的NJ及UPGMA聚类图，结果显示：糯谷猪与柯乐猪聚为一类，关岭猪属于另一类。6、根据贵州地方猪遗传多样性丰富，遗传杂合度较高的结果，以及我省猪种资源现状，提出对我省地方猪，特别是糯谷猪的保护应与开发利用有机地结合，以开发利用推进保护工作。纳雍“糯谷猪”(又叫黄毛猪)是中国优良的地方猪种---黔西北“可乐猪”中的一个特殊类型。本研究结果为我省糯谷猪的保护与开发利用提供了进一步的遗传学依据。