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目的: 1.分析HN001家系的遗传特征和临床表型,建立家系内成员的全基因组DNA标本库。 2.对HN001家系成员的全基因组DNA标本进行测序分析,筛查其致病基因,并定位其致病突变位点。 3.初步分析HN001家系的致病基因突变位点对其编码蛋白功能的影响。 方法: 1.采集HN001家系的基本信息,包括家系内成员是否患病,患者的临床症状、体征、眼科检查等。根据其遗传信息绘制家系图谱,确定疾病的遗传方式。家系内部分成员抽取外周血,提取全基因组DNA样本,-80℃条件下保存待用。 2.采用外显子组芯片捕获联合高通量测序方法对HN001家系内先证者的全基因组DNA样本进行检测,与基因组数据库中的DNA序列进行比对,筛查其致病基因,并分析定位其致病突变位点。 3.对上述得到的先证者的可疑致病基因突变位点进行Sanger测序验证,证实其致病突变位点的可靠性;采用Sanger测序方法对该突变进行家系内验证和家系外验证,证实该突变位点的致病性。 4.根据其突变位点的情况分析其致病基因对编码蛋白结构的影响,并对其编码蛋白进行保守性分析评估该致病基因突变位点的致病性。 结果: 1.根据HN001家系的遗传特征及临床表型,确定其为一个常染色体隐性遗传的视网膜色素变性家系,提取了家系内部分成员的全基因组DNA样本,经鉴定样本达到标准。 2.对HN001家系内先证者的全基因组DNA样本进行检测,结果显示其PDE6B基因第18外显子上存在一个纯合框移突变c.2152_2162delGACCTGTCTGC,为可疑致病突变。 3.对HN001家系内先证者的可疑致病突变进行Sanger测序验证,证实该突变确实存在。随后进行的家系内验证,结果显示该家系内成员中的该突变位点表现为基因型与表型共分离,符合遗传规律,证实该突变位点导致HN001家系的arRP。家系外验证结果显示100个正常人中均不存在此突变位点,进一步证实了该突变位点的RP致病性。 4.PDE6B基因编码蛋白在多个物种间呈高度保守性,而该突变会造成其编码蛋白的氨基酸序列大幅度改变,而且肽链长度大大缩短,推测该突变位点具有较高的致病性。 结论: 1.HN001家系是一个常染色体隐性遗传的视网膜色素变性家系。 2.在HN001家系中成功定位了PDE6B-exon18上的新框移突变位点c.2152_2162delGACCTGTCTGC,是导致arRP的新突变位点,国内外文献及各大基因组数据库均未见报道,丰富了PDE6B基因的突变谱。 3.PDE6B-exon18上的新突变位点会造成其编码蛋白的氨基酸序列大幅度改变,而且肽链长度大大缩短,导致PDE6B编码蛋白结构功能受损,有较高的致病性。