不同来源沙门菌多位点序列分型及药物敏感性分析

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沙门菌广泛分布于自然界,能够引起人和动物胃肠炎、败血症等多种疾病,是对人类和动物健康有极大危害的一类致病菌,由它引起的食物中毒在世界各国的细菌性食物中毒中常常位居前列。食物链中污染了沙门菌会带来高昂的医疗费用并且会导致生产力的降低,具有重要的经济影响。人类沙门菌病主要与进食污染的食物或者与感染动物直接接触有关,蛋、家禽、肉类、牛奶、海产品和生鲜果蔬是沙门菌病的主要传播媒介。随着广谱高效抗菌药物的广泛使用或滥用,引起感染的菌群变迁,出现大量的新型耐药菌株,致使细菌耐药性变异而形成多重耐药,导致沙门菌的耐药性问题日益严重。沙门菌耐药性的不断增强已经成为世界范围的公共健康和卫生问题。沙门菌型别复杂,分型方法众多,其分型方法分为以表型特征为依据的表型分型方法和以基因或基因组结构特征为依据的分子分型方法。由于传统的生化分析和血清学分型不能有效地进行同源性分析,而基于DNA序列研究的MLST方法具有分辨力高、可重复性高、共享性好等优点,在揭示病原菌遗传相关性和稳定性方面具有重要作用。本研究调查了饲料、活禽、猪肉和鸡肉四类样品沙门菌的污染情况,运用MLST方法获取分离株及人源株之间的遗传相关性,同时对不同来源的分离株进行了耐药性比较。2010-2011年间,采集活禽、饲料、猪肉和鸡肉样品1837份,共分离到沙门菌182株,阳性率为9.9%,其中,鸡肉样品分离率最高,达26%。182株细菌包括28种不同的血清型,优势血清型因样品来源不同而有所不同,猪肉样品分离株的优势血清型为德尔卑沙门菌,鸡肉和活禽样品分离株优势血清型为肠炎沙门菌,饲料样品分离株的优势血清型为山夫登堡沙门菌。选取沙门菌7个管家基因aroC、dnaNhemD、hisD、purE、sucA、thrA,对182株样品分离株及73株人源分离株进行MLST研究,共获得37个不同的ST型,并且发现了5个新的ST型。运用eBURST软件分析,可将37个ST型划分为1个同源复合体、2个双联体和1对双位点变异体,其余为独立型。同源复合体包含5个ST型,分别为ST19、ST34、ST99、ST725和New4,该同源复合体的创始型为ST19。255株实验菌株共分为36个血清型和37个ST型,MLST的分型能力与血清型分型能力较为接近,血清型和ST型有着较好的对应关系。对255株沙门菌进行了21种抗菌药物的敏感性试验,结果显示,菌株对萘啶酸和四环素耐药率最高,分别为41.6%和41.2%;对头孢菌素类抗生素及除萘啶酸以外的喹诺酮类抗生素耐药率较低,耐药率均小于5%;对其余抗生素均有不同程度的耐药。共有165株(64.7%)细菌至少对2种抗菌药物耐药。不同来源沙门菌耐药率有所不同,活禽来源沙门菌耐药率最高(100%),鸡肉源和猪肉源沙门菌次之,分别为75%和67.8%,人源沙门菌耐药率为60.3%。鸡肉源沙门菌多重耐药情况最为严重,耐5种及以上抗菌药物的比例达44.7%,其中有2株鸡肉源沙门菌分离株对所用的21种抗生素全部耐药。不同血清型的沙门菌耐药情况也有一定的差异,实验中发现,肠炎沙门菌耐药率最高,鼠伤寒沙门菌、火鸡沙门菌、明斯特沙门菌和德尔卑沙门菌次之,阿贡那沙门菌耐药率最低。
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