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脂肪酸合成酶（FASN）在多种类型的肿瘤中高度表达，并且在肿瘤的发生和转移中具有重要作用。为了阐明FASN在肝癌转移中的作用机制，我们通过靶向蛋白质组学分析，确定了FASN蛋白在肝癌中的相互作用网络。Transwell和划痕实验表明， FASN促进HepG2和SMMC7721细胞的迁移和侵袭。以同位素标记的相对与绝对定量（iTRAQ）为基础的质谱法，对HepG2细胞中与FASN相互作用的蛋白质进行了鉴定。总共鉴定出79种与FASN相互作用的差异蛋白。此外，聚类分析表明FASN相互作用蛋白主要与生物调控和细胞过程相关。用免疫共沉淀法、免疫印迹分析法和共聚焦显微镜法验证FASN与肌动蛋白束蛋白1（FSCN1）、信号诱导增殖相关蛋白1（SIPA1）、血影蛋白β非红细胞型（SPTBN1）和CD59的共沉淀和共定位。在肝癌中FASN的敲低减少了FSCN1、SIPA1、SPTBN1和CD59的表达。此外，在肝癌中抑制FASN、FSCN1或SPTBN1的表达导致上皮间充质转换（EMT）相关标记物，E-钙粘蛋白、N-钙粘蛋白、波形蛋白和转录因子，Snail和Twist在mRNA水平的改变，以及基质金属蛋白酶（MMP）-2和MMP-9蛋白表达的变化。结论：基于iTRAQ的蛋白质组学分析的FASN相互作用蛋白网络可能通过影响EMT和MMPs的功能参与调节肝癌的迁移和侵袭。