【摘 要】
：
基因组规模的基因敲除是研究全局遗传相互作用的一种重要方法。目前,酿酒酵母中的遗传相互作用网络是被揭示得相对全面的。系统性的基因敲除和基因组规模的遗传分析为遗传相互作用的研究提供了重要的基础。但是,大规模的遗传相互作用研究耗时耗力,并且传统的基因敲除方法难以研究涉及多基因的复杂遗传相互作用。酵母合成型基因组中整合了SCRaMbLE系统（Synthetic Chromosome Rearrangeme
论文部分内容阅读
基因组规模的基因敲除是研究全局遗传相互作用的一种重要方法。目前,酿酒酵母中的遗传相互作用网络是被揭示得相对全面的。系统性的基因敲除和基因组规模的遗传分析为遗传相互作用的研究提供了重要的基础。但是,大规模的遗传相互作用研究耗时耗力,并且传统的基因敲除方法难以研究涉及多基因的复杂遗传相互作用。酵母合成型基因组中整合了SCRaMbLE系统（Synthetic Chromosome Rearrangement and Modification by Lox Psym-mediated Evolution）,可以诱导合成型染色体重排,提供了一种产生具有随机删除菌株库的方法。本论文采用酵母合成型三号染色体（synⅢ）开展基因组重排实验。在synⅢ酵母体内通过同源重组方法一次组装了野生型三号染色体（chrⅢ）上的所有14个必需基因,用于替代合成型染色体上必需基因的功能。基于必需基因的成簇化,实现了基因组重排删除synⅢ上的必需基因。此外,通过不同的基因排列顺序（gene order）成簇化组装必需基因,研究基因排列顺序对于基因表达水平的影响。本论文证实了在酵母中成簇化组装chrⅢ上的所有必需基因可以维持基因的相对正常表达。但是,在个别情况下,基因排列顺序影响个别基因的转录水平。在携带成簇化必需基因的合成型酵母中对synⅢ进行染色体重排,探索合成致死基因相互作用。通过检测141株染色体重排删除菌,表明三号染色体上不同区域的DNA片段发生删除的频率不同,存在发生删除的热点区域和冷点区域。对于冷点区域的DNA片段,通过在二倍体酵母中四分体拆孢方法进行片段必需性的验证,发现synⅢ上82-88kb和227-244 kb区域无法被删除,存在合成致死的相互作用。本论文证实了含有成簇化必需基因的基因组重排能够对酵母合成型染色体上含有必需基因的区域进行删除,加强了合成型染色体的精简,也证实了SCRaMbLE是一种研究酵母复杂的遗传相互作用的新策略。
其他文献
材料失效三种形式为断裂、腐蚀和磨损,磨损占60%以上。高性能耐磨钢铁材料的研发,对装备制造的大型化、轻量化和长寿化具有极其重要的意义。传统的耐磨钢铁材料为高锰钢和耐磨铸铁,高锰钢应用场合有局限性,耐磨铸铁需添加合金元素成本高。相比之下,低合金耐磨钢板具有合金含量低、韧塑性高、焊接性能好、可折弯成型等优点,被广泛应用于工程机械、矿山机械、冶金机械和水泥化工机械等装备的制造,是一种重要的耐磨钢铁材料。
24拜耳法生产氧化铝适用于高品位铝土矿,且存在赤泥渣中氧化铝、氧化钠含量高的问题。我国有大量的高硅一水铝石型铝土矿不能得到高效利用。目前利用拜耳法工艺每生产1吨氧化铝,都会产生1.2～1.4 吨的赤泥。随着铝土矿资源的日益匮乏,矿石品位逐渐降低,从而使得赤泥量增大,氧化铝和碱的损失也随之增大。针对以上问题,本课题组提出了“钙化-碳化法”处理低品位铝土矿及赤泥的新工艺,新工艺能够充分提取资源中的氧化
海洋观测是一切海洋工作的基础,通过运用现代化技术和设备对海洋环境进行监督管理,可提高海洋环境信息的科学化、数字化程度。水下滑翔机作为一种新型水下航行器,能源消耗极低且隐蔽性强,可执行大范围、长时间的水下观测任务,因此为水下滑翔机设计合理的观测路径可提高设备的自主能力和安全性,对加强我国海洋研究水平和国防建设等方面具有十分重要的意义。本论文首先对水下滑翔机的运动原理和运动学模型进行简要分析,为规划算
结构制造作为海洋工程模块制造过程中的重要环节,它的过程信息的管理对海洋工程模块制造的工期和质量起着决定性的作用。随着信息技术的发展以及数据采集方法的普及,海工装备的制造过程更加数字化、信息化和高效化。本文以海洋工程模块为研究对象,根据其钢结构制造过程的工艺流程和信息特点,开发出与之匹配的海洋工程模块结构制造信息跟踪系统。覆盖了海洋工程模块结构制造的全过程和各阶段,从材料到成型模块。该系统可以解决当
生产调度问题在现实生产环境中中起着不可替代的作用,是整个生产管理系统的重要组成部分,批调度问题是生产调度问题中最主要的分支之一,在多个领域有着广泛的应用。精准的调度对生产计划的有效实施,高效低耗地使用生产资源,均衡生产及准时生产,减少在制品的资金占用起着十分显著的作用。生产系统中,工件的到达时间、尺寸和机器容量等不确定因素会对生产调度的运行产生很大的影响。研究工件动态到达的不相关平行机批调度问题对
黄色粘球菌和铜绿假单胞菌作为环境中普遍存在的生物被膜菌,都具有出色的表面运动能力,通过产生胞外基质调控自身的运动行为及生物被膜的形成,但关于二者相互作用的研究却很少。本课题分别从黄色粘球菌分泌的胞外多糖（exopolysaccharides,EPS）对铜绿假单胞菌表面运动的影响和黄色粘球菌捕食铜绿假单胞菌这两个方面,来探究它们之间的相互作用关系。我们首先通过黄色粘球菌DK1622和铜绿假单胞菌在玻
按氧化过程中有无酶的参与,葡萄糖传感器分为酶葡萄糖传感器和无酶葡萄糖传感器两类。由于酶的性质活泼、固定困难及成本高等原因,使得酶传感器的应用受到限制。近年来,对方便、快捷、高性能及低成本的无酶葡萄糖生物传感器的研究成为相关领域的热点。泡沫镍（NF）是一种具有3D结构的材料,具有大的比表面积和丰富的孔隙,这使得反应分子或离子很容易通过材料中的孔隙达到或离开其界面,而且在碱性介质中,其表面存在Ni（O
新型钴基高温合金具有与镍基高温合金相似的γ’相,而受到广泛关注。其力学行为研究较多,而氧化行为研究较少。与力学性能一样,优异的抗氧化性能亦为合金安全服役不可或缺的。为此,本论文以两种（0C和5C）新型钴基高温合金为对象,采用循环氧化方法研究了其在900℃和1000℃下的循环氧化行为,及预氧化对合金1000℃氧化行为的影响。研究了 0C和5C合金在900℃和1000℃下的循环氧化行为。结果表明,两合
蓝细菌拥有直接固定CO2的能力,除了适合成为自养型“细胞工厂”用于异源合成化学物质外,其自身所富含的碳水化合物（如蔗糖）也被认为是一种潜在的可再生原料,可被用来作为支持异养菌“细胞工厂”生产生物燃料和精细化学品的碳源。然而,产糖蓝细菌的纯培养体系非常容易染菌,且碳水化合物的分离和纯化过程将大大增加工业生产成本。因此,在本研究中,我们构建了一个由快速生长的蓝细菌Synechococcus elong
微生物基因组文库的构建有利于得到性状各异的优势菌株,便于更加深入地探究微生物的应用价值及遗传物质的生物学信息。为了高效地实现基因组规模的扰动来建立表型各异的菌株文库,本次研究基于解脂酵母自身非同源末端修复机制,开发了一种基因组建库技术。本次研究发现高产菌株中的外源片段通过非同源末端连接（Non-homologous end joining,NHEJ）的方式随机整合到解脂酵母基因组的不同位点。并成功