急性下呼吸道感染住院患儿病毒病原学及人博卡病毒分子流行病学研究

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本文主要从以下几部分展开: 第一部分: 目的: 急性下呼吸道感染(acute lower respiratory tract infections,ALRI)是婴幼儿时期的主要死亡原因,其主要的致病因子为病毒,因此明确ALRI患儿病毒感染情况对ALRI的病因诊断和防治将有重要的意义。本文的目的是研究北京儿童医院5岁以下儿童ALRI住院患儿中病毒感染情况及其临床特征。 方法: 1.收集2004年~2006年冬季(11月至次年2月)因ALRI在北京儿童医院住院治疗的5岁以下患儿鼻咽吸出物333份,男230例,女103例,年龄为1月至58月。 2.同时采用聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增技术和病毒分离方法对标本进行呼吸道病毒检测,将PCR阳性扩增产物和分离获得的阳性毒株测序进行鉴定。 3.检测的呼吸道病毒包括呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial vires,RSV)、腺病毒(adenovirus,AdV)、副流感病毒1~4型(parainfluenza virus,PIV)、鼻病毒(rhinovirus,RhV)、人偏肺病毒(human metapneumovirus,hMPV)、冠状病毒(human coronavirus,HCoV)及人博卡病毒(human bocavirus,HBoV)7种病毒,采用HEp-2和Vero两种细胞对鼻咽吸出物进行病毒分离。 结果: 1.333份鼻咽吸出物中病毒检测为阳性的标本共123份,病毒总的阳性检出率为36.94%(123/333)。123份阳性标本中,采用PCR方法检测阳性的为121份,其中9份合并病毒分离阳性;另有2份PCR阴性标本,病毒分离阳性。 2.病毒分离情况:采用HEp-2和Vero两种细胞进行病毒分离得到11株病毒株,经PCR扩增及序列测定检测证实均为AdV,其中AdV1型2株,AdV2型3株,AdV3型3株,AdV7型3株。 3.阳性标本中单纯RSV阳性标本90例,占阳性标本总数的73.17%(90/123);单纯AdV阳性7例,占5.69%(7/123);单纯HBoV阳性13例,占10.57%(13/123);单纯RhV阳性1例,占0.81%(1/123);RSV合并AdV感染9例,占7.32%(9/123);RSV合并HBoV感染3例,占2.44%(3/123)。未检测到副流感病毒、人偏肺病毒及冠状病毒感染。 4.病毒检测阳性患儿的中位年龄为5.5月(年龄为1.6月至58月,平均年龄为10.5月)。其中年龄为6月以下70例,占阳性病例的56.91%(70/123);6月~1岁26例,占21.14%(26/123);1~3岁20例,占16.26%(20/123);3岁以上7例,占5.69%(7/123)。所有病毒检测阳性患儿临床均有咳嗽及胸片异常表现,发热占86.99%(107/123),喘息占77.24%(95/123)。临床诊断为肺炎60例(48.78%,60/123),毛细支气管炎50例(40.65%,50/123),急性支气管炎9例(7.32%,9/123),哮喘合并肺炎1例(0.81%,1/123),哮喘合并支气管炎3例(2.44%,3/123)。临床诊断为重症ALRI 10例,占重症患儿的33.33%(10/30);轻症ALRI 113例,占轻症患儿的37.29%(113/303)。 结论: 1.病毒是北京儿童医院2004年~2006年冬季ALRI住院患儿的重要病原。 2.RSV感染在病毒感染中占首位;AdV感染存在,感染的血清型包括AdV1型、2型、3型及7型;HBoV可能是ALRI的重要病原。 第二部分: 目的:人博卡病毒(Human Bocavirus,HBoV)是2005年新发现的可引起儿童及成人呼吸道疾病的细小病毒。本文的目的是研究北京儿童医院5岁以下儿童急性下呼吸道感染(acute lower respiratory tract infections,ALRI)住院患儿中HBoV感染的分子流行病学特征。 方法: 1.收集2004年~2006年冬季(11月至次年2月)因ALRI在北京儿童医院住院治疗的5岁以下患儿鼻咽吸出物333份,男230例,女103例,年龄为1月至58月。 2.同时采用聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增技术和病毒分离方法对标本进行HBoV检测。病毒分离采用HEp-2和Vero两种细胞。 3.将获得的HBoV NS1基因PCR阳性扩增产物进行序列测定,采用Sequencher、BioEdit和MEGA生物软件对阳性标本与GeneBank中的参考株HBoV st1和HBoV st2进行基因亲缘性关系分析和序列比对分析。 结果: 1.333份标本中采用PCR方法检测到16份HBoV阳性扩增产物,阳性率为4.80%(16/333),其中3例合并RSV感染,混合感染率为18.75%(3/16)。 2.病毒分离情况:采用HEp-2和Vero两种细胞进行病毒分离未得到HBoV阳性毒株。 3.基因序列测定和比较分析:基因亲缘性关系分析显示,本实验中获得的HBoVNS1基因扩增的DNA片段在基因亲缘性关系树上与HBoV参考株st1、st2形成一簇,而与HBoV参考株st1相比,本研究的毒株与HBoV参考株st2的核苷酸同源性水平更高,为98.5~100%,因此本研究的毒株与HBoV参考株st2更为接近。序列比较分析显示,本实验中获得的HBoV NS1基因扩增的DNA片段与HBoV参考株st1、st2的核苷酸同源性分别为98.1~98.5%、98.5~100%,与HBoV参考株st1、 st2的氨基酸同源性均为98.6~100%。 4.HBoV阳性患儿的中位年龄为8月(年龄为3月至57月,平均年龄为17月)。年龄在3岁以下的14例,占87.5%(14/16),1岁以下的9例,占56.25%(9/16),其中年龄在6个月以下的7例,占43.75%(7/16)。该16例HBoV阳性患儿临床均有咳嗽及胸片异常,发热及喘息表现占60%以上。临床诊断为肺炎10例(62.5%,10/16),毛细支气管炎2例(12.5%,2/16),急性支气管炎2例(12.5%,2/16),哮喘合并肺炎1例(6.25%,1/16),哮喘合并支气管炎1例(6.25%,1/16)。临床诊断为重症ALRI 3例(18.75%,3/16),轻症ALRI 13例(81.25%,13/16)。1例HBoV阳性患儿死亡。 结论: 2004年~2006年冬季北京儿童医院ALRI住院患儿HBoV感染的毒株与HBoV参考株st2更为接近。
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