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目的:对前期从药用植物内部组织分离得到的4株潜在放线菌新种进行多相分类和其中一株链霉菌新种的次级代谢产物进行研究,以期充分开发、利用我国丰富的特境放线菌资源,有效地发现新的抗生素,促进我国放线菌的发展,面对我国新型抗生素研发滞后的困境,提供新的研究思路。方法:首先,采用多相分类(包括分子分类研究、培养特征、形态特征观察、生理生化特性和细胞化学组分分析)对菌株M8JJ-5~T,M1HQ-2~T,N5BH11~T,M2CJ-2~T进行鉴定。其次,选择其中的链霉菌新种M2CJ-2~T,对其进行全基因组测序及生物信息学分析,大量发酵,发酵液预处理后采用ODS柱层析、凝胶柱层析、高效液相等分离手段分离纯化其中的次级代谢产物。结果:完成分别为来源于夹竹桃的菌株M8JJ-5~T、黄芩的菌株M1HQ-2~T、薄荷的菌株N5BH11~T和大蓟的菌株M2CJ-2~T等4株药用植物内生放线菌潜在新种的鉴定。完成其中的放线菌新种M2CJ-2~T全基因组测序及生物信息学分析,结果表明其共有29个次级代谢产物合成基因簇,可编码产生聚酮类、非核糖体肽类、萜类、丁内酯类、细菌素类、四氢嘧啶类、含铁细胞类、β内酯类、梯烷类等化合物。29个次级代谢产物合成基因簇中的10个进行了核心结构预测,25个合成基因簇可能编码产生curamycin、informatipeptin、borrelidin、landomycin、streptovaricin、heronamide、feglymycin、stenothricin等。菌株M2CJ-2~T还含有4个新生物合成基因簇,具有产生新化合物的可能。对潜在新种M2CJ-2~T次级代谢产物进行研究。目前得到两个化合物S5-2-1与S5-4-1。其结构尚待解析。结论:综合系统发育分析、形态特征、培养特征、生理生化特征和化学成分分析,菌株M8JJ-5~T代表了Amnibacterium属的一个新种,命名为Amnibacterium flavum sp.nov。菌株M1HQ-2~T是短杆菌属的一个新种,命名为Brachybacterium endophyticum sp.nov.。菌株N5BH11~T代表了一个新的Nakamurella属物种,命名为Nakamurella flava sp.nov.。菌株M2CJ-2~T为链霉菌属的一个新种,命名为Streptomyces cirsii sp.nov.。菌株M2CJ-2~T富含次级代谢产物合成基因簇,是从天然来源中发现新结构抗生素的重要资源。